结论：老板扣员工工资，无论金额多少，只要属于无故扣减，员工都有权通过劳动仲裁来维护自己的合法权益。不过，从实际操作和维权效率的角度考虑，如果涉及金额较小，员工也可以先尝试与老板协商或向劳动监察部门投诉；若协商或投诉无果，再申请劳动仲裁。
详细分析如下：
一、劳动仲裁的适用范围与前提条件
劳动仲裁是处理用人单位与劳动者之间因劳动合同等发生的争议的有效途径，包括劳动报酬争议。当老板无故扣减员工工资时，这便构成了劳动报酬争议，员工有权申请劳动仲裁。但需要注意的是，如果老板扣钱存在合理依据（如员工故意或重大过失导致单位损失，且扣除程序合法），则仲裁请求可能难以得到支持。因此，在提起仲裁前，员工需仔细评估扣钱的合理性。
二、劳动仲裁的流程与要点
收集证据：
- 证据是劳动仲裁成功的关键。员工应收集劳动合同、工资条/银行工资流水、考勤记录、工作证/门禁卡/同事证言、聊天记录/邮件等证据材料，以证明老板无故扣减工资的事实。
准备并提交仲裁申请书：
- 仲裁申请书需载明劳动者与用人单位的基本信息、仲裁请求（明确要求用人单位支付被扣工资及可能的补偿）、事实和理由（详细描述扣钱情况，包括金额、时间、原因，并提供证据支持）以及证据清单。
- 将仲裁申请书（一式三份）、身份证复印件、用人单位工商登记信息及证据材料一并提交至劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会。
参与仲裁庭审：
- 仲裁庭在裁决前会尝试调解。若双方达成调解协议，则制作调解书，经签收后生效。
- 如调解不成，仲裁庭将开庭审理。员工需按要求陈述、举证、质证，确保事实清晰、证据有力。
- 仲裁庭根据证据和庭审情况作出裁决。裁决一般在受理申请之日起45日内作出，复杂案件可延期15日。
执行仲裁裁决：
- 如用人单位在规定期限内履行裁决，支付被扣工资及补偿，则仲裁流程结束。
- 如用人单位拒不履行，员工可在裁决书规定的履行期满后向人民法院申请强制执行。
三、特殊情况下的法律责任
- 刑事责任：若用人单位拒不支付一名劳动者三个月以上劳动报酬，且数额达五千元至二万元，或拒不支付十名以上劳动者劳动报酬，数额累计达三万元至十万元，则可能承担刑事责任。不过，这一标准主要针对的是恶意欠薪且情节严重的情形，与员工申请劳动仲裁的直接关联性不强，但可作为员工了解用人单位违法后果的参考。
- 恶意欠薪：即使拖欠金额未达到刑事责任标准，但用人单位存在恶意欠薪行为（如逃匿、转移财产等），员工仍可通过法律途径追究其责任。在劳动仲裁中，员工可以提供相关证据证明用人单位的恶意欠薪行为，以增加仲裁请求得到支持的可能性。
四、实际操作建议
- 金额较小时的处理：如果涉及金额较小，如几百元，员工可以先尝试与老板协商或向劳动监察部门投诉。这种方式可能更为高效便捷，能够迅速解决问题。
- 金额较大或协商无果时的处理：如果涉及金额较大或协商无果，员工应及时申请劳动仲裁。在申请仲裁前，务必充分收集证据，确保仲裁请求得到支持。
总结与建议：老板扣员工工资，无论金额多少，员工都有权通过劳动仲裁来维护自己的合法权益。在实际操作中，员工应根据具体情况选择合适的维权方式，并充分收集证据以支持自己的仲裁请求。如果你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。