结论：员工侵占公司财产但不够刑事立案标准时，一般不能直接通过劳动仲裁解决，但可根据具体情况选择其他法律途径。以下从不同角度详细分析：

一、劳动仲裁的适用范围与限制

劳动仲裁主要解决的是劳动争议，包括但不限于劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止，以及劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训、劳动保护等事项。员工侵占公司财产的行为，并不直接属于劳动争议的范畴，因此，一般情况下，劳动仲裁机构不会直接受理此类案件。

二、员工侵占公司财产的法律性质

员工侵占公司财产，如果数额较大，可能构成刑法中的职务侵占罪或贪污罪（视员工身份而定）。但若数额未达到刑事立案标准，则不构成犯罪，属于民事侵权或违反公司规章制度的行为。

三、非刑事立案标准下的处理途径

1. 民事诉讼：

   • 公司可以依据《民法典》中关于侵权责任的规定，向法院提起民事诉讼，要求员工返还侵占的财产，并赔偿因此造成的损失。
   • 民事诉讼的举证责任在公司，需要提供充分的证据证明员工侵占了公司财产，以及侵占的具体数额。

2. 公司内部处理：

   • 如果公司有完善的规章制度，且规章制度中明确规定了员工侵占公司财产的处理方式，公司可以依据规章制度对员工进行内部处理，如警告、罚款、解除劳动合同等。
   • 但需要注意的是，公司内部处理应遵循合法、合理、公正的原则，不得侵犯员工的合法权益。

3. 劳动监察投诉：

   • 如果员工的行为同时违反了劳动法律法规，如未按照劳动合同约定履行义务等，公司可以向当地劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门介入调查并处理。
   • 但劳动监察部门主要处理的是劳动法律法规的违反行为，对于员工侵占公司财产的行为，如果未构成犯罪且不属于劳动争议范畴，劳动监察部门可能无法直接处理。

四、特殊情况下的劳动仲裁可能性

虽然员工侵占公司财产一般不属于劳动争议范畴，但如果员工的行为与劳动合同的履行、解除等事项存在关联，且因此引发了劳动争议，如公司因此解除劳动合同而员工认为解除行为违法等，此时劳动争议可能涉及员工侵占公司财产的事实认定。在这种情况下，劳动仲裁机构可能会在处理劳动争议的过程中，对员工侵占公司财产的事实进行审查和认定。但即便如此，劳动仲裁机构也不会直接对员工侵占公司财产的行为进行裁决或处罚，而是会将其作为劳动争议处理的一个相关事实来考虑。

建议：针对员工侵占公司财产的行为，公司应首先评估侵占的数额和性质，如果数额较大且构成犯罪，应及时向公安机关报案；如果数额未达到刑事立案标准，则可以考虑通过民事诉讼、公司内部处理或劳动监察投诉等途径来维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。