公司认为员工职务侵占但没有证据，一般情况下是无法立案的。职务侵占罪属于公诉案件，公安机关在决定是否立案时，需要有一定的犯罪事实材料作为依据，并且这些材料需要能够证明犯罪事实的存在，同时还需要追究犯罪嫌疑人的刑事责任。若公司没有提供任何证据，仅是基于怀疑而报案，公安机关通常会因为证据不足而不予立案。
立案条件与证据要求
犯罪事实存在：公安机关立案的首要条件是存在犯罪事实。在职务侵占案件中，这通常意味着需要有初步的证据来证明员工确实实施了侵占行为。
需要追究刑事责任：除了犯罪事实的存在，还需要证明该行为需要追究刑事责任。这通常涉及到侵占的数额是否达到立案标准等问题。
属于公安机关管辖：案件还需要属于公安机关的管辖范围，即案件性质、地域等因素需要符合公安机关的立案条件。
无证据时的处理建议
收集初步证据：公司可以通过查看财务账目、交易记录、业务流程等方式，尝试收集一些初步的证据来证明员工的侵占行为。这些证据可以是书面的，也可以是电子的，或者是通过其他方式获得的。
与员工沟通：在收集到一定证据后，公司可以尝试与员工进行沟通，了解其对此事的解释。但需要注意的是，沟通时要谨慎，避免打草惊蛇，导致员工销毁或隐藏证据。
向公安机关报案：当公司收集到足够的证据后，可以向公安机关报案。公安机关在受理报案后，会进行进一步的侦查，收集更确凿的证据。如果公安机关认为构成犯罪，会依法追究责任。
注意事项
避免浪费司法资源：公司不应仅凭怀疑就随意报案，以免浪费司法资源。在报案前，应尽可能收集到足够的证据来支持自己的主张。
保护员工合法权益：在处理此类案件时，公司也应确保员工的合法权益得到保护。不应因为怀疑而侵犯员工的名誉权、隐私权等合法权益。
完善内部管理：为了避免类似情况的发生，公司应完善内部管理机制，加强财务监督和业务审核，确保公司的财产安全。
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