结论：合同中约定仲裁条款是在乙方所在地仲裁委员会仲裁，该条款的有效性取决于多个因素，主要包括能否清晰确定“乙方所在地”及该所在地是否有明确、唯一的仲裁机构。若能满足这些条件，则仲裁条款通常有效；反之，则可能导致仲裁条款无效或不明确。
一、仲裁条款有效性的基础
根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，有效的仲裁协议必须包含请求仲裁的意思表示、明确的仲裁事项以及选定的仲裁委员会。这是仲裁条款有效性的三大基石，缺一不可。
二、乙方所在地仲裁条款的明确性要求
明确“乙方所在地”的指向：
- 在合同中，必须能够清晰确定“乙方所在地”具体指的是哪一方当事人的所在地，以避免因指向不明而产生的争议。例如，如果合同中明确指出了乙方的注册地址或主要营业地，那么该所在地就是明确的。
确定具体的仲裁委员会：
- 约定“乙方所在地仲裁”时，该所在地应有明确且唯一的仲裁机构。如果乙方所在地有多个仲裁机构，且无法从合同或其他文件中确定具体选择哪一个，那么这种约定可能被视为不明确。
结合实际情况判断：
- 在实践中，法院或仲裁机构会结合当事人陈述、合同签订和履行情况等因素，综合判断“乙方所在地”所指向的仲裁委员会是否明确。例如，如果合同是在乙方所在地签订的，且双方均在该地有业务活动，那么“乙方所在地仲裁”通常可理解为乙方所在地的仲裁委员会。
三、特殊情况的处理原则
乙方所在地没有设立仲裁委员会的情况：
- 如果合同约定的“乙方所在地”没有设立仲裁委员会，应根据有利于认定仲裁协议有效的原则进行解释。例如，可以认定为该地的上一级市设立的仲裁委员会，或者所在省有且仅有一个仲裁委员会的，亦可以认定为该省仲裁委员会。但这一解释并非绝对，具体还需结合合同内容和双方意图进行判断。
乙方所在地存在多家仲裁委员会的情况：
- 当“乙方所在地”有多家仲裁委员会时，若当事人不能就选择其中一家达成一致意见，这种约定通常会被视为不明确，进而导致仲裁协议无效。因此，在起草仲裁条款时，应尽量避免此类模糊表述，明确指定具体的仲裁委员会。
四、实际应用中的建议
明确约定仲裁委员会名称：
- 在起草仲裁条款时，应尽量明确约定具体的仲裁委员会名称，以避免后续因约定不明确而产生的纠纷。例如，可以约定“由乙方所在地的XX仲裁委员会仲裁”。
确保仲裁条款符合法定要件：
- 除了明确具体的仲裁机构外，合同中的仲裁条款还需表明双方请求仲裁的意愿，并明确仲裁事项的范围。同时，要确保仲裁条款不违反法律的强制性规定，不涉及不能仲裁的事项。
充分沟通并确认仲裁条款内容：
- 在签订合同时，双方应充分沟通并确认仲裁条款的条款内容，以确保其有效性和可执行性。如果对仲裁条款有任何疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师进行解答和指导。
总结：合同中约定仲裁条款是在乙方所在地仲裁委员会仲裁的有效性取决于多个因素的综合判断。在起草和审查仲裁条款时，应谨慎对待每一个细节，以确保仲裁条款的有效性和可执行性。如果您对仲裁条款的有效性有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。