合同约定在甲方所在地仲裁，其有效性取决于多个因素，但核心结论是：在符合法律规定且双方真实意思表示的情况下，该约定是有效的。以下是对此问题的详细分析：

一、仲裁协议的有效性要件

1. 双方真实意思表示：

   • 仲裁协议必须是双方自愿、平等协商后达成的合意，任何一方不得利用优势地位强迫对方接受仲裁条款。

2. 书面形式：

   • 根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条，仲裁协议应当具有书面形式，包括合同中的仲裁条款或单独的仲裁协议。口头约定仲裁是无效的。

3. 明确的仲裁事项和选定的仲裁委员会：

   • 仲裁协议应明确约定仲裁的具体事项（如合同纠纷）以及选定的仲裁委员会（如甲方所在地的某仲裁委员会）。若仅约定“在甲方所在地仲裁”而未明确仲裁委员会，则可能因约定不明确而无效。

二、甲方所在地仲裁的合法性分析

1. 符合实际联系要求：

   • 甲方所在地通常与合同履行、权利义务关系具有直接关联，因此可以作为仲裁地。但关键在于仲裁协议中是否明确选定了具体的仲裁委员会。

2. 不违反级别管辖和专属管辖：

   • 仲裁与诉讼不同，不受级别管辖和专属管辖的限制。因此，只要仲裁协议有效，双方就可以约定在甲方所在地的仲裁委员会进行仲裁，无论案件性质或标的额大小。

三、可能导致仲裁协议无效的情形

1. 约定不明确：

   • 如前所述，若仲裁协议中仅约定“在甲方所在地仲裁”而未明确仲裁委员会，则可能因约定不明确而被认定无效。

2. 违反法律强制性规定：

   • 虽然仲裁不受级别管辖和专属管辖的限制，但若仲裁协议的内容违反法律、行政法规的强制性规定（如仲裁事项超出法律规定的范围），则该协议无效。

3. 无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议：

   • 若一方为无民事行为能力人或限制民事行为能力人，其订立的仲裁协议可能因缺乏行为能力而无效。

四、实际操作中的建议

1. 明确仲裁委员会：

   • 在签订仲裁协议时，应明确约定具体的仲裁委员会名称和地址，以避免后续争议。

2. 书面形式确认：

   • 确保仲裁协议以书面形式存在，并作为合同的一部分或单独的仲裁协议文件。

3. 了解仲裁规则和程序：

   • 在约定仲裁前，双方应了解所选仲裁委员会的仲裁规则和程序，以确保仲裁的公正性和效率。

五、示例说明

假设甲乙双方签订了一份买卖合同，并在合同中约定：“因本合同产生的任何争议，双方同意提交至甲方所在地的XX仲裁委员会进行仲裁。”该约定符合仲裁协议的有效性要件，因此是有效的。若双方发生争议，任何一方都可以依据该仲裁协议向XX仲裁委员会申请仲裁。

总结与建议：在合同中约定在甲方所在地仲裁时，应确保仲裁协议明确、具体，并符合法律规定的有效性要件。若您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。