结论：员工特种作业证费用是否可以从工资上报销，需视具体情况而定，包括公司规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规的规定。
分析角度一：公司规章制度与劳动合同约定
公司规章制度：如果公司有明确的规章制度规定，员工取得特种作业证的费用可以由公司承担，或者通过工资报销的形式进行补偿，那么员工就有权要求公司按照制度执行。这种情况下，从工资上报销特种作业证费用是合法的，也是公司履行其规章制度的一种体现。
劳动合同约定：劳动合同是员工与公司之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了公司应承担员工取得特种作业证的费用，或者通过工资报销的方式进行补偿，那么公司就必须按照合同约定执行。否则，公司可能构成违约，需要承担相应的法律责任。
分析角度二：相关法律法规的规定
劳动法相关规定：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，员工有权获得与其工作相关的必要培训，并且公司应当为员工提供必要的劳动条件。虽然直接的法律条文可能并未明确提及特种作业证费用的报销问题，但可以从劳动法的立法精神出发，认为公司有义务为员工提供取得特种作业证所需的支持和帮助，包括费用的报销。然而，这并非绝对，具体还需结合实际情况和地方性法规进行判断。
地方性法规与政策：不同地区可能对于员工取得特种作业证的费用报销问题有具体的规定或政策。例如，某些地区可能出台了相关政策，鼓励或要求公司承担员工取得特种作业证的费用。在这种情况下，公司就必须遵守地方性法规与政策的规定，从工资上报销特种作业证费用。
建议与注意事项：
与公司协商：如果员工希望公司从工资上报销特种作业证费用，首先可以尝试与公司进行协商，了解公司的规章制度和劳动合同中是否有相关规定或约定。
了解地方性法规：员工还可以了解所在地区是否有关于特种作业证费用报销的具体规定或政策，以便更好地维护自己的权益。
保留相关证据：如果员工与公司就特种作业证费用报销问题产生争议，建议员工保留好相关证据，如培训费用发票、劳动合同、公司规章制度等，以便在必要时进行维权。
咨询专业律师：如果员工在处理此类问题时遇到困难或不确定如何操作，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。