基本工资和补贴不一起发放，是否合理需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律层面分析
劳动合同约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当明确约定劳动报酬的构成，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等。如果劳动合同中明确约定了基本工资和补贴的发放时间、方式等，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照约定执行是合法的。
工资支付规定：
- 《工资支付暂行规定》等法规要求用人单位按时足额支付劳动者工资，但并未明确规定基本工资和补贴必须一起发放。因此，只要用人单位在约定的时间内，按照约定的金额支付了劳动者应得的工资（包括基本工资和补贴），即使它们不是同时发放，也不构成违法。
二、实际操作层面分析
用人单位内部规定：
- 有些用人单位可能出于内部管理、财务处理等方面的考虑，制定了基本工资和补贴分开发放的规定。如果这种规定不违反法律法规，且已经向劳动者进行了明确告知和解释，那么劳动者应当遵守。
劳动者权益保护：
- 尽管法律没有明确规定基本工资和补贴必须一起发放，但劳动者有权要求用人单位按时足额支付其应得的工资。如果用人单位存在拖欠、克扣工资等违法行为，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
三、特殊情况分析
补贴性质：
- 如果补贴属于工资性收入的一部分，且劳动合同或用人单位规章制度中明确规定了其发放时间和方式，那么用人单位应当按照约定执行。如果补贴属于非工资性收入，如福利、奖励等，其发放时间和方式可能更加灵活，但同样需要遵守相关法律法规和用人单位的规章制度。
劳动者异议：
- 如果劳动者对基本工资和补贴的发放方式有异议，可以与用人单位进行协商。如果协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位按照法律法规和劳动合同的约定支付工资。
四、建议
审查劳动合同：
- 劳动者应当仔细审查自己的劳动合同，了解其中关于工资构成、发放时间、方式等条款的约定。
与用人单位沟通：
- 如果对工资发放方式有疑问或异议，劳动者应当及时与用人单位进行沟通，了解具体情况并寻求解决方案。
维护合法权益：
- 如果用人单位存在违法行为或侵犯劳动者权益的行为，劳动者应当及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
总结来说，基本工资和补贴不一起发放是否合理，取决于劳动合同的约定、用人单位的规章制度以及相关法律法规的规定。如果用人单位的做法符合这些规定，且已经向劳动者进行了明确告知和解释，那么这种做法是合法的。如果劳动者对此有异议或认为用人单位存在违法行为，可以及时向相关部门投诉或申请劳动仲裁。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。