结论：个体户撤店是否需要向员工支付赔偿金，这主要取决于撤店的原因、劳动合同的约定以及相关法律法规的规定。以下分情况详细说明：

1. 因经营不善等非员工原因撤店：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位因经营不善等原因需要裁员的，应当提前三十日向工会或者全体职工说明情况，听取工会或者职工的意见后，裁减人员方案经向劳动行政部门报告，可以裁减人员。同时，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。
   • 经济补偿计算：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
   • 示例：如果员工在个体户工作了3年，月工资为5000元，那么个体户在撤店时，应向该员工支付3个月工资，即15000元作为经济补偿。

2. 因员工严重违反规章制度等原因撤店（即合法解除劳动合同）：

   • 法律背景：如果员工存在严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害等情形，用人单位可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
   • 建议：在此情况下，个体户应确保有充分的证据证明员工的违规行为，并按照法定程序进行解除劳动合同的操作，以避免法律风险。

3. 劳动合同中有特别约定：

   • 法律背景：如果劳动合同中明确约定了撤店时的赔偿或补偿条款，那么个体户应按照合同约定履行义务。
   • 建议：个体户在签订劳动合同时，应仔细审查合同条款，确保合同内容合法、合规，并明确双方的权利和义务。

4. 未提前通知或未依法支付经济补偿：

   • 法律后果：如果个体户未提前三十日通知员工撤店或未依法支付经济补偿，员工有权向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求个体户支付赔偿金或经济补偿。
   • 赔偿金计算：如果个体户违法解除劳动合同，员工有权要求支付赔偿金，赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍。

进一步思考与建议：

• 个体户在撤店前，应充分评估撤店的原因和后果，确保撤店决定合法、合规。
• 如果需要裁员，应提前与员工沟通，并按照法定程序进行操作，以避免法律风险。
• 如果对撤店过程中的法律问题存在疑问或不确定，建议及时咨询专业律师，以确保自身权益得到保障。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。