关于停薪留职合同解除后的补偿问题，这确实是一个涉及多方面因素的情况，需要具体分析。以下是我为您详细梳理的解答：
一、补偿的基本原则
停薪留职期间，虽然员工不在岗，但劳动关系依然存续。因此，解除劳动合同时的经济补偿应遵循《劳动合同法》的相关规定。补偿的数额和方式，主要取决于解除劳动合同的原因以及双方的具体约定。
二、用人单位无需支付补偿的情形
- 劳动者存在过错：
- 如果停薪留职员工在停薪留职期间严重违反了用人单位的规章制度，如多次旷工、营私舞弊给单位造成重大损害，或者因犯罪行为被依法追究刑事责任等，用人单位有权解除劳动合同且无需支付经济补偿。但用人单位应确保有充分的证据支持其解除决定，并遵循法定程序。
三、用人单位需支付补偿的情形
协商一致解除：
- 如果用人单位与停薪留职员工双方协商一致解除劳动合同，那么用人单位应按照《劳动合同法》第四十七条的规定，向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算方式是：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
用人单位违法解除：
- 如果用人单位没有法定理由，随意辞退停薪留职员工，则属于违法解除劳动合同。根据《劳动合同法》第八十七条的规定，用人单位应依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
四、特殊情况的补偿处理
劳动合同期满：
- 如果停薪留职期间劳动合同期满，且用人单位决定不再续订劳动合同，那么用人单位应向劳动者支付经济补偿。但如果用人单位维持或提高劳动合同约定条件续订劳动合同，而劳动者不同意续订的，则无需支付经济补偿。
用人单位经营困难：
- 如果用人单位因生产经营发生严重困难等客观经济情况发生重大变化，导致劳动合同无法履行，且劳动者在停薪留职期间受到影响被辞退，那么用人单位也应支付经济补偿。
五、停薪留职协议的重要性
- 停薪留职是一个特定历史时期的产物，目前法律法规对其并无统一明确的规定。因此，具体的权利义务通常由用人单位和员工签订的停薪留职协议来确定。当发生纠纷时，协议内容也是判断双方权利义务以及是否应支付补偿的重要依据。所以，在签订停薪留职协议时，双方应明确各自的权利和义务，以避免后续纠纷。
六、关于停薪留职期间的工龄计算
- 停薪留职期间虽未实际在公司上班，但通常仍计入工龄，除非双方另有约定或法律法规有特殊规定。因此，在计算经济补偿或赔偿金时，应将该期间纳入考虑范围。
综上所述，停薪留职合同解除后的补偿问题需要根据具体情况来判断。无论是用人单位还是劳动者，在解除劳动合同时都应遵循相关法律法规，确保合法合规。如果对此仍有疑问或需要进一步的法律帮助，建议咨询专业律师以维护自身合法权益。