结论前置：事业单位在连续两年对员工作出不称职评价并决定解聘时，需要通知工会。

法律背景与依据：

1. 《劳动合同法》的相关规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十三条：“用人单位单方解除劳动合同，应当事先将理由通知工会。用人单位违反法律、行政法规规定或者劳动合同约定的，工会有权要求用人单位纠正。用人单位应当研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。”
   • 这一条款明确规定了用人单位在单方解除劳动合同时，有义务事先将解除理由通知工会，并听取工会的意见。

2. 事业单位解聘的特殊性：

   • 事业单位虽然有其特殊性，但在劳动关系的处理上，仍需遵循《劳动合同法》的基本原则。事业单位与员工之间的劳动关系，同样受到《劳动合同法》的保护和约束。
   • 因此，当事业单位决定连续两年对员工作出不称职评价并解聘时，这一行为属于单方解除劳动合同的范畴，必须遵循《劳动合同法》中关于通知工会的规定。

法律建议与后果：

1. 法律建议：

   • 事业单位在决定解聘连续两年不称职的员工前，应事先将解聘理由通知工会，并听取工会的意见。这有助于确保解聘决定的合法性和合理性，减少劳动纠纷的发生。
   • 如果工会提出异议或建议，事业单位应认真研究并考虑工会的意见。如果最终决定解聘，应将处理结果书面通知工会。

2. 可能的法律后果：

   • 如果事业单位未按照《劳动合同法》的规定通知工会就单方解除劳动合同，可能面临劳动仲裁或诉讼的风险。在仲裁或诉讼中，这一行为可能被视为违法解除劳动合同，需要承担相应的法律责任，如支付赔偿金等。

实际操作中的注意事项：

• 事业单位在通知工会时，应确保通知内容的准确性和完整性，包括解聘的理由、依据以及员工的个人信息等。
• 工会收到通知后，有权对解聘决定提出异议或建议。事业单位应认真对待工会的意见，并在最终决定解聘前进行充分的研究和考虑。
• 如果事业单位最终决定解聘员工，应确保解聘决定的合法性和合理性，并按照规定支付相应的经济补偿或赔偿金。

总结：事业单位在连续两年对员工作出不称职评价并决定解聘时，必须遵循《劳动合同法》中关于通知工会的规定。这是确保解聘决定合法性和合理性的重要步骤，也是减少劳动纠纷的有效途径。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。