关于事业单位工作人员连续两年不称职是否有补偿的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

1. 事业单位人事管理制度：

   • 事业单位的人事管理通常遵循国家的相关规定和制度。对于工作人员的考核、奖惩、晋升等都有明确的规定。
   • 一般情况下，如果工作人员连续两年被评定为不称职，根据事业单位的人事管理制度，可能会面临调整岗位、降低职级、解除聘用合同等处理措施。

2. 补偿问题：

   • 在事业单位人事管理制度中，对于因不称职而被解除聘用合同的工作人员，通常不会给予经济补偿。因为不称职是对工作人员工作能力和表现的一种负面评价，与单位解除聘用合同是基于对工作能力和表现的不认可。
   • 当然，具体是否有补偿还需要看单位的具体规定和劳动合同中的相关条款。如果劳动合同中有明确约定，在不称职的情况下解除聘用合同需要给予经济补偿，那么单位就需要按照劳动合同的约定执行。

3. 法律建议：

   • 如果你是一名事业单位工作人员，且面临连续两年不称职的评定，建议首先查阅单位的人事管理制度和劳动合同，了解具体的规定和条款。
   • 如果对单位的处理措施有异议，可以与单位进行沟通协商，或者通过法律途径维护自己的合法权益。

综上所述，事业单位工作人员连续两年不称职通常不会有经济补偿，但具体还需要看单位的具体规定和劳动合同的约定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。