结论：事业编改制为企业编后，新企业是否有权开除员工，主要取决于员工在事业编期间犯罪行为的性质、时间以及新企业的规章制度和相关法律规定。以下从不同角度进行分析：
一、犯罪行为的时间与性质
犯罪行为发生在事业编期间，但尚未被发现或处理：
- 如果员工在事业编期间犯罪，但当时未被发现或处理，改制后新企业发现该犯罪行为时，新企业是否有权开除员工，需依据新企业的规章制度以及《劳动合同法》的相关规定来判断。
- 一般来说，如果犯罪行为严重违反了新企业的规章制度或职业道德，新企业有权依据《劳动合同法》第三十九条的规定解除劳动合同。
犯罪行为发生在事业编期间，且已被处理：
- 如果员工在事业编期间的犯罪行为已经被依法处理，如被判处刑罚或受到行政处罚，且该处理结果在改制时已经明确，新企业通常不能仅凭此前的犯罪行为直接开除员工。
- 但是，如果新企业的规章制度中明确规定了对于有犯罪记录员工的处理方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，新企业可以依据规章制度进行处理。
犯罪行为发生在改制过程中或改制后：
- 如果犯罪行为发生在改制过程中或改制后，且员工已经转为企业编，新企业有权依据《劳动合同法》和企业的规章制度对员工进行处理，包括开除。
二、新企业的规章制度
- 新企业的规章制度是处理员工违纪行为的重要依据。如果规章制度中明确规定了对于犯罪行为的处理方式，如开除、降职等，新企业可以依据规章制度进行处理。
- 但是，规章制度必须合法合规，不得违反法律法规的强制性规定，否则可能面临被撤销或无效的风险。
三、相关法律规定
- 根据《劳动合同法》第三十九条的规定，劳动者被依法追究刑事责任的，用人单位可以解除劳动合同。这一规定适用于所有用人单位，包括改制后的新企业。
- 但是，需要注意的是，“被依法追究刑事责任”通常指的是员工被判处刑罚的情况。如果员工仅受到行政处罚或免于刑事处罚，新企业不能直接依据此条款开除员工。
四、实际操作建议
- 审查规章制度：新企业应审查自身的规章制度，确保对于犯罪行为的处理方式合法合规。
- 收集证据：如果新企业发现员工有犯罪行为，应收集相关证据，如法院判决书、行政处罚决定书等。
- 依法处理：根据收集到的证据和规章制度，新企业应依法对员工进行处理，确保处理过程合法合规。
- 咨询专业律师：在处理此类复杂问题时，新企业可以咨询专业律师，以确保处理方式的合法性和有效性。
总结与启示：事业编改制为企业编后，新企业对于员工在事业编期间的犯罪行为是否有权开除，需综合考虑犯罪行为的时间、性质、新企业的规章制度以及相关法律规定。新企业应依法制定并执行规章制度，确保在处理员工违纪行为时合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。