在劳动仲裁中，如果申请人仅告总公司而未告分公司，仲裁机构一般不能依职权主动追加分公司为当事人，但存在例外情况。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般原则：仲裁机构不依职权主动追加
在劳动仲裁程序中，仲裁机构的管辖权和当事人的确定通常基于申请人的仲裁申请。如果申请人仅将总公司列为被申请人，而未将分公司列为被申请人，仲裁机构一般不会主动依职权追加分公司为当事人。这是因为仲裁程序遵循“不告不理”的原则，即仲裁机构只处理申请人提出的仲裁请求和涉及的当事人。
二、例外情况：特定条件下可追加
尽管存在上述一般原则，但在某些特定条件下，仲裁机构或法院（如果案件进入诉讼阶段）可能会考虑追加分公司为当事人。这些条件通常包括：
分公司与总公司存在法律上的关联关系：
- 如果分公司与总公司在法律上具有紧密的关联关系，如分公司是总公司的分支机构，且总公司的行为直接影响到分公司的权益或义务，那么在这种情况下，为了全面、公正地解决争议，仲裁机构或法院可能会考虑追加分公司为当事人。
分公司实际承担了相关责任：
- 如果在实际操作中，分公司是实际承担与争议相关责任的一方，而总公司只是名义上的当事人，那么为了保障实际责任方的权益和确保争议的公正解决，仲裁机构或法院也可能会考虑追加分公司为当事人。
申请人提出追加申请并得到支持：
- 如果申请人在仲裁过程中发现遗漏了分公司作为当事人，并且能够提供充分的证据证明分公司与争议具有直接关联，那么申请人可以向仲裁机构提出追加申请。如果仲裁机构认为申请合理且有必要，可能会同意追加分公司为当事人。不过，这一过程通常需要申请人主动提出，并经过仲裁机构的审查和决定。
三、实际操作建议
明确仲裁请求和当事人：
- 在提起劳动仲裁前，申请人应仔细分析争议事实和法律关系，明确仲裁请求和涉及的当事人。如果分公司与争议具有直接关联，应考虑将其列为被申请人之一。
及时提出追加申请：
- 如果在仲裁过程中发现遗漏了分公司作为当事人，申请人应及时向仲裁机构提出追加申请，并提供充分的证据证明分公司与争议的关联性和必要性。
咨询专业律师：
- 由于劳动仲裁程序涉及复杂的法律关系和程序规定，申请人在提起仲裁前或仲裁过程中遇到疑问时，应及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和指导。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。