结论前置：在劳动争议仲裁中，仲裁机构不认定劳动关系的情况主要包括缺乏有效证据、劳动合同无效以及双方关系不符合劳动关系特征等。以下是对这些情况的详细分析：

1. 缺乏有效证据：

   • 法律依据：根据劳动保障部《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号）及相关法律规定，劳动关系的认定需要依据一系列证据，包括工资支付记录、身份证明文件、招用记录、考勤记录等。
   • 具体情形：若双方未签订书面劳动合同，且劳动者无法提供上述参考凭证或其他有效证据证明存在事实劳动关系，仲裁机构将难以认定劳动关系的存在。例如，劳动者无法提供工作证、工资条或考勤记录等，且用人单位也否认与劳动者存在劳动关系时，仲裁机构可能不认定劳动关系。

2. 劳动合同无效：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的无效情形包括违反法律法规的强制性规定、存在欺诈或胁迫等情形。
   • 具体情形：若双方签订的劳动合同因上述原因被认定为无效，仲裁机构将不认定基于该无效合同产生的劳动关系。例如，用人单位以欺诈手段使劳动者在违背真实意思的情况下签订劳动合同，该合同无效，仲裁机构可能不认定双方存在劳动关系。

3. 双方关系不符合劳动关系特征：

   • 法律依据：劳动关系的核心特征是管理与被管理、支配与被支配的关系。若双方关系更符合平等主体间的合作关系、承揽关系等，则不符合劳动关系的特征。
   • 具体情形：例如，在个人承包项目中，承包人自行组织人员完成工作任务，不受发包方日常劳动管理，这种情况下双方关系更符合承揽关系特征，仲裁机构可能不认定劳动关系。又如，劳动者与用人单位之间签订的是合作协议或承揽合同，且实际履行过程中也符合合作或承揽关系的特征，仲裁机构同样可能不认定劳动关系。

法律程序与救济途径：

• 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，当用人单位与劳动者之间就是否存在劳动关系发生争议时，可依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
• 若对仲裁裁决不服，双方还可依法向人民法院提起诉讼，通过司法程序进一步维护自身权益。

建议与提醒：

• 劳动者在入职时应尽量与用人单位签订书面劳动合同，并妥善保管相关证据材料，如工资条、工作证、考勤记录等，以备不时之需。
• 用人单位也应依法与劳动者签订劳动合同，并建立健全的劳动管理制度，避免因劳动关系认定问题引发不必要的法律纠纷。

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