结论：商家是否承担责任，需根据具体情况判断，主要看能否证明食品安全问题与面包在店内时的状态存在因果关系，以及商家是否尽到了合理的安全保障义务。以下从不同角度进行分析：

一、从因果关系角度分析

1. 若能证明食品安全问题与面包在店内状态有关：

   • 如果顾客能够提供证据（如医疗证明、专业鉴定等），证明其第三天出现的食品安全问题（如食物中毒）是由在店内购买的、超过48小时的面包引起的，那么商家可能需要承担责任。
   • 商家在这种情况下，可能需要证明其在销售面包时，面包是符合食品安全标准的，且没有因存储不当等原因导致面包变质。如果商家无法证明这一点，那么根据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定，商家可能需要承担赔偿责任。

2. 若无法证明食品安全问题与面包在店内状态有关：

   • 如果顾客无法提供充分证据证明其食品安全问题是由在店内购买的面包引起的，那么商家可能不需要承担责任。
   • 在这种情况下，商家可以主张其销售的面包在离开店铺时是符合食品安全标准的，且顾客在购买后已经超过了合理的食用期限（如48小时），因此商家不应承担责任。

二、从商家安全保障义务角度分析

1. 商家未尽到合理安全保障义务：

   • 如果商家在销售面包时，未明确告知顾客面包的保质期、存储条件等关键信息，或者面包本身存在明显的质量问题（如发霉、变质等），而商家仍然销售给顾客，那么商家可能未尽到合理的安全保障义务。
   • 在这种情况下，即使顾客在购买后超过了48小时才出现食品安全问题，商家也可能需要承担一定的责任。

2. 商家已尽到合理安全保障义务：

   • 如果商家在销售面包时，已经明确告知了顾客面包的保质期、存储条件等关键信息，且面包在离开店铺时是符合食品安全标准的，那么商家可能已经尽到了合理的安全保障义务。
   • 在这种情况下，如果顾客在购买后超过了48小时才出现食品安全问题，且无法证明该问题与面包在店内时的状态有关，那么商家可能不需要承担责任。

三、法律建议

1. 对于顾客：

   • 在购买食品时，务必注意查看食品的保质期、生产日期等关键信息，并妥善保存购物凭证。
   • 如果在食用食品后出现不适症状，应及时就医并保留相关医疗证明。
   • 如果怀疑食品安全问题与在店内购买的食品有关，可以及时向商家反映并协商解决，或者向相关部门投诉举报。

2. 对于商家：

   • 在销售食品时，务必确保食品符合食品安全标准，并明确告知顾客食品的保质期、存储条件等关键信息。
   • 如果顾客反映出现食品安全问题，商家应积极配合调查并承担相应的责任（如果确实存在责任的话）。
   • 商家可以定期对店内食品进行质量检查，确保销售的食品始终符合食品安全标准。

总结：商家是否承担责任需根据具体情况判断，关键在于能否证明食品安全问题与面包在店内时的状态存在因果关系，以及商家是否尽到了合理的安全保障义务。如果顾客或商家对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。