关于两年前公立医院辞职违约金现在是否还能拿回来的问题，这主要取决于当时签订的劳动合同或相关协议中的具体条款，以及这些条款是否符合现行法律法规的规定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 合同条款的合法性：

   • 首先，需要审查当时签订的劳动合同或辞职协议中关于违约金的条款。根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定由劳动者承担违约金的情形仅限于两种：一是用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训，并约定服务期，劳动者违反服务期约定的；二是用人单位与劳动者约定了竞业限制条款，劳动者违反竞业限制约定的。如果公立医院与您约定的违约金不属于这两种情形之一，那么该违约金条款可能因违反法律强制性规定而无效。
   • 若违约金条款无效：您无需支付该违约金，且如果之前已经支付，理论上可以要求医院返还。但实际操作中，由于时间已经过去两年，返还的难度可能会增加，需要您提供充分的证据证明支付事实及违约金条款的无效性。

2. 时效问题：

   • 即使违约金条款有效，也需要考虑诉讼时效的问题。根据《民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。从您辞职并支付违约金（如果已支付）之日起算，如果已经超过三年，且没有诉讼时效中断、中止的情形，那么医院可能无法再通过法律途径要求您支付违约金，同样，您要求返还违约金的请求也可能因超过诉讼时效而得不到法院的支持。
   • 但需注意：如果医院在您辞职后的三年内并未主张违约金，且您也未主动提出返还，那么诉讼时效的问题可能不会成为阻碍。然而，由于时间已经过去两年，接近诉讼时效的临界点，因此建议您尽快采取行动。

3. 实际操作建议：

   • 收集证据：首先，您需要收集所有与辞职和违约金相关的证据，包括劳动合同、辞职协议、支付违约金的凭证等。
   • 咨询专业意见：由于法律问题具有复杂性，建议您咨询专业律师（即我，黄祖军律师，专注于婚姻家庭、劳动纠纷领域），以便更准确地评估您的法律地位和可能的法律后果。
   • 协商或诉讼：根据律师的建议，您可以尝试与医院协商解决此事，或者如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决。但请务必注意诉讼时效的问题，以免错过维权时机。

总结来说，两年前公立医院辞职违约金现在是否还能拿回来，取决于多个因素，包括合同条款的合法性、诉讼时效以及您能否提供充分的证据等。因此，我建议您尽快咨询专业律师，以便更准确地评估您的法律地位和制定合适的维权策略。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。