结论：医疗期结束厂里让停薪留职是否合法，需分情况讨论，一般来说，若未经劳动者同意，厂里单方面决定停薪留职是不合法的。

分析：

1. 医疗期与停薪留职的基本概念：

   • 医疗期：是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。在这个期间，用人单位应支付病假工资或疾病救济费，且不得解除劳动合同。
   • 停薪留职：通常指职工在一定期限内离开原岗位，保留劳动关系但暂停工资发放的一种安排。这种安排一般需要双方协商一致，并签订相关协议。

2. 医疗期结束后的处理：

   • 医疗期结束后，劳动者应返回原岗位工作。如果劳动者因身体原因无法从事原工作，用人单位应根据劳动者的实际情况，调整其工作岗位或安排其他合适的劳动。
   • 若劳动者医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同，但需支付经济补偿。

3. 停薪留职的合法性：

   • 未经劳动者同意：如果用人单位在医疗期结束后，未经劳动者同意，单方面决定让劳动者停薪留职，这是不合法的。因为停薪留职通常需要双方协商一致，并签订书面协议。
   • 经劳动者同意：如果劳动者同意停薪留职，并签订了相关协议，那么这种安排是合法的。但协议中应明确停薪留职的期限、待遇、复职条件等关键条款。

4. 可能的法律后果：

   • 如果用人单位未经劳动者同意单方面决定停薪留职，劳动者有权要求用人单位支付医疗期内的病假工资或疾病救济费，并可能要求用人单位继续履行劳动合同或支付经济补偿。
   • 如果劳动者因停薪留职而遭受损失，如无法支付生活费用、无法享受社会保险待遇等，劳动者有权要求用人单位承担相应的赔偿责任。

建议：

• 对于劳动者而言，如果医疗期结束后用人单位提出停薪留职，应仔细审查相关协议条款，确保自己的权益不受损害。如果不同意停薪留职，应明确表达自己的意愿，并要求用人单位提供合适的工作岗位或支付经济补偿。
• 对于用人单位而言，应遵守相关法律法规，尊重劳动者的权益。在提出停薪留职时，应与劳动者充分协商，并签订书面协议明确双方的权利和义务。

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