社保部门在办理补缴时，对于双方间劳动关系的确认，并非必须先经仲裁裁决程序，但存在争议时建议先通过仲裁或诉讼确认劳动关系。具体分析如下：

1. 无争议情况下的直接补缴
   若用人单位与劳动者对劳动关系存续期间无争议（例如双方签订书面劳动合同、工资发放记录完整等），社保部门可直接依据现有证据（如劳动合同、工资流水、考勤记录等）办理社保补缴手续，无需以仲裁裁决为前置条件。此时，社保部门会重点审查补缴期限、缴费基数等是否符合规定。

2. 存在争议时的处理路径
   若双方对劳动关系是否存在、存续期间等存在争议（例如未签书面合同、劳动者主张未缴期间存在事实劳动关系等），社保部门通常会要求劳动者先通过劳动仲裁或法院诉讼确认劳动关系。这是因为：

   • 法律程序要求：根据《劳动争议调解仲裁法》第二条，确认劳动关系属于劳动争议范畴，需通过仲裁或诉讼解决；
     
   • 社保部门职权限制：社保部门无权直接认定劳动关系，其职责是执行生效法律文书或双方无争议的协议。若强行补缴，可能因劳动关系认定错误引发行政复议或诉讼风险。

3. 实务中的灵活处理
   部分地区社保部门可能允许劳动者在申请补缴时提交初步证据（如工作证、同事证言等），并签署《劳动关系承诺书》，先行办理补缴，后续若发生争议再通过法律程序解决。但这种方式存在政策差异，需以当地社保部门要求为准。

建议：

• 若劳动关系无争议，直接向社保部门提交补缴申请及证据材料；
  
• 若存在争议，优先通过劳动仲裁确认劳动关系（时效为1年，自知道权益受损之日起计算），再凭裁决书申请补缴；
  
• 补缴时注意保留工资发放记录、考勤记录等证据，以支持补缴期间的主张。
  

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