在补交社保时，若需要通过确认劳动关系来申请劳动仲裁，确实会涉及到仲裁时效的问题。以下是对这一问题的详细解答：
一、仲裁时效的基本原则
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年。这一时效期间是从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起开始计算的。这是处理劳动争议案件，包括补缴社保争议的基本时效原则。
二、补缴社保的具体时效规定
一般情况：
- 劳动者在请求用人单位补缴社会保险费时，原则上应在劳动关系存续期间提出。如果劳动关系已经终止，那么劳动者应当在劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请，以确保自己的权益不受时效限制的影响。
特殊情况：
- 劳动保障监察部门对于用人单位未按时足额缴纳社会保险费的行为，其查处的时效为两年。这个期限是从违反劳动保障法律、法规或规章的行为发生之日起计算的。如果该行为有连续或继续状态，那么时效将从行为终了之日起计算。
- 需要注意的是，有些地区可能认为社保征缴属于行政管理范畴，因此不适用劳动仲裁的一年时效规定，而是允许劳动者随时要求用人单位补缴社保。然而，这一做法取决于具体地区的法律法规和政策解读，所以劳动者在申请前应详细了解当地的相关规定。
三、时效的中止与中断
- 中止：如果因不可抗力（如自然灾害、战争等）或有其他正当理由（如劳动者因病无法行动等）导致当事人无法在规定的仲裁时效期间内申请仲裁，那么仲裁时效将中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间将继续计算。
- 中断：当劳动者向用人单位主张补缴社保的权利，或者向有关部门进行投诉、举报等，以及用人单位同意履行补缴义务时，仲裁时效将中断。从中断时起，仲裁时效期间将重新计算。
四、申请劳动仲裁补缴社保的注意事项
- 及时提起：劳动者在发现自己的社保权益受到侵害时，应尽快向劳动仲裁机构提起仲裁申请，以避免超过时效期间而丧失法律保护。
- 准备证据：在申请劳动仲裁时，劳动者应提交充分的证据来支持自己的主张，如工资条、社保缴纳记录、劳动合同等。这些证据将有助于证明用人单位未依法缴纳社保的事实。
- 了解当地政策：由于补缴社保的具体时效规定可能因地区而异，劳动者在申请劳动仲裁前应仔细了解当地的相关法规和政策，以确保自己的申请符合法律要求。
综上所述，补交社保时若需要通过确认劳动关系来申请劳动仲裁，确实会受到仲裁时效的限制。劳动者应及时关注自身社保权益，了解当地的相关法规和政策，并在规定的时效内主张补缴社保，以有效维护自身的合法权益。