在停工留薪期内申请的年假原则上不予批准，已休的年假通常不抵扣停工留薪期，且工资待遇按原标准执行。以下是具体分析：

1. 停工留薪期与年假的性质差异
   停工留薪期是职工因工伤或职业病暂停工作接受治疗的法定期间，期间工资福利待遇不变，由用人单位按月支付。而年假是职工依法享受的带薪休假，用于休息、放松。两者性质不同，停工留薪期具有强制性保障属性，年假则属于福利性休假。根据《企业职工带薪年休假实施办法》第六条，职工依法享受的探亲假、婚丧假、产假等国家规定的假期，以及因工伤停工留薪期间，不计入年休假假期。因此，停工留薪期内原则上不得安排年假。

2. 已休年假的处理规则
   若职工在停工留薪期内已休年假，需分情况处理：

   • 用人单位主动安排：若单位在职工停工留薪期内强制安排年假，可能违反《工伤保险条例》对工伤职工的特殊保护规定，职工可要求单位补足停工留薪期工资差额（如年假期间工资低于原工伤待遇）。
     
   • 职工主动申请：若职工自行申请并经单位同意休年假，实践中通常视为双方协商一致，但根据前述规定，已休的年假不抵扣停工留薪期，单位仍需按原标准支付停工留薪期工资。

3. 实务建议

   • 对职工：若单位在停工留薪期内安排年假，可明确拒绝并要求享受完整停工留薪期待遇；若已休年假，可保留工资发放记录，若待遇降低可主张补足。
     
   • 对用人单位：应严格区分停工留薪期与年假，避免混淆导致法律风险；若职工主动申请休年假，建议书面确认“不抵扣停工留薪期”并留存证据。

总结：停工留薪期是工伤职工的法定保障期间，年假的安排需以不损害其权益为前提。若遇争议，建议结合具体证据（如工伤认定书、休假审批单、工资条等）进一步分析。如有其他细节需补充，可随时向我咨询。