结论：您可以申请劳动仲裁来主张未发放的年终绩效考核工资部分，但能否得到支持需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议，适用本法。年终绩效考核工资作为劳动报酬的一部分，若用人单位未按照约定或规定发放，劳动者有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
二、可能的情况分析
劳动合同或规章制度中有明确约定：
- 如果您的劳动合同或公司的规章制度中明确规定了年终绩效考核工资的发放条件、标准和时间，且您符合发放条件但公司未发放，那么您申请劳动仲裁时，仲裁机构很可能会支持您的诉求，要求公司补发这部分工资。
劳动合同或规章制度中无明确约定，但存在事实劳动关系和实际发放记录：
- 即使劳动合同或规章制度中没有明确规定年终绩效考核工资，但如果您能提供证据证明公司过去有发放年终绩效考核工资的惯例，或者您与公司之间存在事实上的年终绩效考核工资约定（如口头约定、邮件往来等），且您符合发放条件但公司未发放，仲裁机构也可能根据实际情况支持您的诉求。
公司存在恶意拖欠或拒不支付的情况：
- 如果公司存在恶意拖欠或拒不支付年终绩效考核工资的行为，这不仅违反了劳动合同或规章制度的约定，也可能违反了相关法律法规的规定。在这种情况下，您申请劳动仲裁时，仲裁机构很可能会严厉制裁公司的违法行为，并要求公司立即补发工资及可能产生的滞纳金或赔偿金。
您不符合发放条件或存在过错：
- 如果年终绩效考核工资的发放与您的绩效表现、出勤情况、工作态度等因素挂钩，且您因不符合发放条件或存在过错（如严重违反公司规章制度、给公司造成重大损失等）而未被发放这部分工资，那么您申请劳动仲裁时可能难以得到支持。
三、法律建议
收集证据：
- 在申请劳动仲裁前，建议您尽可能收集与年终绩效考核工资相关的证据，如劳动合同、规章制度、绩效考核表、工资条、邮件往来、聊天记录等。这些证据将有助于证明您的诉求和公司的违法行为。
与公司协商：
- 在申请劳动仲裁前，您也可以尝试与公司进行协商，看是否能通过友好协商的方式解决争议。如果公司愿意补发工资或达成其他和解协议，那么这将是最快捷、最经济的解决方式。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果或公司拒绝补发工资，您可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁。在申请仲裁时，请务必按照仲裁机构的要求填写仲裁申请书、提交相关证据材料，并按时参加仲裁庭审。
寻求法律援助：
- 如果您在申请劳动仲裁过程中遇到困难或需要法律帮助，可以随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
四、可能的法律后果
如果仲裁机构支持您的诉求，公司将被要求补发年终绩效考核工资及可能产生的滞纳金或赔偿金。如果公司拒不执行仲裁裁决，您还可以向人民法院申请强制执行。相反，如果仲裁机构不支持您的诉求，您可能需要考虑其他解决方式或接受这一结果。
最后，申请劳动仲裁是维护自己合法权益的一种有效方式。在申请前，请务必充分了解相关法律法规和程序要求，并收集好相关证据材料。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。