在股东有纠纷的情况下重刻公章，需谨慎处理，核心原则是确保程序合法合规，避免引发新的法律风险或纠纷。具体处理方式需分情况讨论：

1. 若公司章程或股东协议已明确公章管理规则
   需严格按章程或协议执行。例如，若章程规定“重刻公章需经全体股东一致同意”，则必须取得所有股东签字；若规定“需董事会决议”，则需召开董事会并形成有效决议。
   风险提示：若未履行章程程序擅自重刻，可能构成“伪造公司印章罪”（刑法第280条），或被股东起诉要求确认公章无效，公司需承担赔偿责任。

2. 若章程未明确规则，但公司存在有效决议机制
   可通过股东会或董事会决议重刻公章。需注意：

   • 决议程序需合法（如提前通知、表决权比例符合规定）；
     
   • 决议内容需明确“原公章作废、新公章效力及使用范围”；
     
   • 决议需留存书面文件，并由参会股东签字确认。
     实践建议：可同步在工商部门备案新公章，增强公示效力。

3. 若股东纠纷已导致公司治理瘫痪（如无法形成有效决议）
   此时重刻公章需分两步：

   • 第一步：通过法律程序确认重刻必要性
     可向法院起诉，请求判令公司重刻公章（案由：公司证照返还纠纷或公司决议纠纷）。需提交证据证明原公章被非法控制（如被个别股东私藏）、公司运营受阻（如无法签订合同、无法开户等）。
     
   • 第二步：凭生效判决申请重刻
     持法院判决书到公安机关备案，重新刻制公章。新公章刻制后，需及时通知全体股东、客户及合作伙伴，并通过公告、邮件等方式公示原公章作废。
     风险提示：若未通过法律程序擅自重刻，可能被其他股东主张“新公章无效”，导致合同纠纷或行政处罚。

4. 特殊情形：公章被个别股东私藏或滥用
   若股东纠纷中，个别股东私藏公章并用于非法目的（如私自签订合同、转移资产），公司可：

   • 向公安机关报案，控告其“盗窃、侵占公司财物”或“伪造公司印章”；
     
   • 同时向法院起诉，请求判令该股东返还公章，并赔偿损失；
     
   • 若公章已被滥用，需及时通知相关方（如合同相对方、银行等），声明原公章作废，避免公司承担不必要的责任。

总结建议：股东纠纷中重刻公章，核心是“程序合法+证据充分”。建议优先通过协商或法律程序明确重刻依据，避免单方行动引发更大争议。若需进一步分析具体纠纷背景或协助起草决议文件，可随时向我咨询。