结论概述：针对“法人收回印章，股东重新刻印章”的情况，这涉及到公司内部治理和印章管理的问题，可能引发一系列法律后果。具体处理方式需根据实际情况判断，包括但不限于确认印章的合法性、评估对公司的影响、采取法律措施等。
一、确认印章的合法性
法人收回印章的合法性：
- 首先，需要确认法人（即公司法定代表人）收回印章的行为是否合法。这通常取决于公司章程、股东会或董事会的决议，以及相关法律法规的规定。
- 如果法人收回印章的行为未经合法程序或违反公司章程，那么该行为可能被视为无效，股东有权对此提出异议。
股东重新刻印章的合法性：
- 股东重新刻印章的行为同样需要合法依据。如果股东未经公司合法授权或违反公司章程、相关法律法规的规定擅自刻制印章，那么该印章可能被视为非法印章，不具有法律效力。
二、评估对公司的影响
对公司运营的影响：
- 印章是公司对外进行法律行为的重要凭证。如果法人收回印章导致公司无法正常使用印章进行业务活动，可能会对公司运营造成严重影响。
- 股东重新刻制印章如果未经合法授权，可能会导致公司印章管理混乱，增加公司法律风险。
对股东关系的影响：
- 法人收回印章和股东重新刻制印章的行为可能引发股东之间的矛盾和纠纷，影响公司内部治理和股东关系。
三、采取法律措施
内部协商解决：
- 在发生此类纠纷时，首先建议通过内部协商的方式解决。股东之间、股东与法人之间可以就印章的保管、使用等问题进行协商，达成一致意见并签订相关协议。
寻求法律救济：
- 如果内部协商无法解决问题，股东或法人可以寻求法律救济。例如，可以向法院提起诉讼，要求确认印章的合法性、要求返还非法刻制的印章、要求赔偿因印章问题造成的损失等。
- 在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明自己的主张，包括公司章程、股东会或董事会决议、相关法律法规的规定等。
报警处理：
- 如果股东重新刻制印章的行为涉嫌伪造公司印章等违法行为，法人或公司可以向公安机关报案，要求追究相关责任人的刑事责任。
四、预防措施与建议
完善公司章程和内部管理制度：
- 公司应完善公司章程和内部管理制度，明确印章的保管、使用、审批等流程，确保印章管理的规范化和合法化。
加强印章管理：
- 公司应加强对印章的管理，建立印章使用登记制度，对印章的使用情况进行实时监控和记录。
提高法律意识：
- 公司股东和法人应提高法律意识，了解相关法律法规的规定，避免因无知而引发法律纠纷。
五、特殊情况处理
- 如果公司存在多个印章且均具有法律效力（如因历史原因或特殊业务需要），那么需要明确各印章的使用范围和权限，避免混淆和滥用。
- 如果法人收回印章的行为是基于公司利益考虑且经过合法程序，但股东对此有异议，那么股东可以通过合法途径表达自己的意见和诉求，但不应擅自重新刻制印章。
最后，针对此类问题，建议公司股东和法人保持冷静和理性，通过合法途径解决问题。如果仍有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。