司机在事故中死亡是否算工亡，需根据具体情况判断，但一般符合工伤认定标准的情况下，应被认定为工亡。以下是从不同角度的详细分析：
一、工伤认定的一般标准与法律依据
根据《工伤保险条例》第十四条，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。对于司机而言，如果其是在执行工作任务（如驾驶公司车辆进行运输）过程中发生交通事故导致死亡，且本人对事故不负主要责任或全部责任，那么通常可以认定为工伤。
二、具体情形分析
因工作原因导致的交通事故：
- 司机在正常执行驾驶任务时，属于其工作时间和工作内容范畴。若在此过程中因工作原因（如遵守交通规则、避让行人、执行运输任务等）发生交通事故导致死亡，且不存在故意犯罪、醉酒、吸毒、自残或自杀等《工伤保险条例》第十六条明确排除的情形，则通常应被认定为工伤。
突发疾病死亡：
- 若司机在工作时间和工作岗位突发疾病（如心梗、脑溢血等）并因此死亡，或者在48小时之内经抢救无效死亡，根据《工伤保险条例》第十五条的规定，也应视同工伤处理。但需注意，这种情况需要满足“工作时间+工作岗位”的双重要件，且突发疾病与工作无直接关联性要求（但实践中通常认为与工作有一定间接联系，如工作压力等可能诱发疾病）。
特殊情况的排除：
- 如前所述，若司机的事故死亡是由于故意犯罪、醉酒、吸毒、自残或自杀等原因导致的，则根据《工伤保险条例》第十六条的规定，不应认定为工伤。
上下班途中的事故：
- 一般情况下，上下班途中发生的事故不被视为工伤。但如果是从事与工作有关的预备性或者收尾性工作而受到事故伤害的，也可能被认定为工伤。然而，对于普通司机而言，单纯的上下班途中驾车发生事故通常不属于工伤范畴，除非该事故与工作有直接关联（如下班后直接前往另一个工作地点途中发生事故）。
三、工伤认定的申请流程与材料
- 申请流程：司机的家属如需申请工伤认定，应在规定时间内（一般为事故伤害发生之日起1年内）向用人单位所在地社会保险行政部门提交相关材料。若用人单位未按规定提出，则工伤职工或其近亲属、工会组织可提出。
- 所需材料：包括工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料、医疗机构出具的诊断证明等。对于交通事故，还需提供交通事故责任认定书等证明材料。
四、实际建议
- 及时申请：家属在得知司机事故死亡后，应尽快向用人单位或社会保险行政部门了解工伤认定流程，并准备相关材料及时申请。
- 保留证据：在事故发生后，应尽可能保留与事故相关的所有证据，如交通事故责任认定书、医疗记录、工作记录等，以便在申请工伤认定时提供有力支持。
- 咨询专业：在处理此类复杂法律问题时，建议家属直接向我咨询，以便更准确地了解法律程序和权益保障措施。
综上所述，司机在事故中死亡是否算工亡需结合具体的事故原因和情况来判断。但一般情况下，只要符合工伤认定的一般标准或视同工伤的情形，且不存在排除认定工伤的特殊情形，就应被认定为工伤。