病假期间工资全扣是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与原则
- 医疗期保护：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工享有医疗期的权利。在医疗期内，企业不得随意解除劳动合同，且应支付病假工资或疾病救济费。
- 病假工资标准：劳动部《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第59条明确规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准，但不能低于最低工资标准的80%。这是病假工资支付的最低标准，用人单位必须遵守。
二、合法与违法情况分析
合法情况：
- 按公司制度扣除绩效奖金：若公司的规章制度明确规定，病假期间不享受绩效奖金或其他与工作成果挂钩的奖励，且该制度经过民主程序制定并公示，那么公司有权按照制度扣除这部分奖金。但基本工资部分不得随意扣除，且病假工资总额不得低于当地最低工资标准的80%。
- 劳动合同或规章制度有更高约定：如果劳动合同或用人单位规章制度中有更高标准的病假工资约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则按照合同或制度约定执行。
违法情况：
- 无故克扣基本工资：如果公司在员工病假期间无故克扣其基本工资，这显然是违法的。基本工资是员工劳动报酬的重要组成部分，受法律保护。
- 低于法定标准支付病假工资：如前所述，病假工资或疾病救济费不能低于当地最低工资标准的80%。如果公司支付的病假工资低于这一标准，也构成违法。
- 以旷工为由扣除全部工资：如果员工已按规定履行了请假手续，且提供了有效的病假证明，公司却以旷工为由扣除其全部工资，这是不合法的。
三、应对措施与建议
- 沟通协商：劳动者认为用人单位在病假期间扣钱的行为违法时，首先应与用人单位进行沟通协商，要求其纠正错误做法，并支付应得的病假工资。
- 保留证据：在请假过程中，务必保留好相关的证据材料，如医院出具的病假证明、请假申请表、工资条等。这些证据在发生争议时将成为维护自己权益的重要依据。
- 法律维权：若协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，需要提交相关证据材料，并按照仲裁机构的程序要求进行操作。
四、实际案例与启示
在实际操作中，曾有劳动者因病假期间工资被全扣而与公司发生争议。经过劳动仲裁或诉讼程序后，法院或仲裁机构通常都会根据相关法律法规和证据材料来判定公司的行为是否合法。如果公司的行为确实违法，那么劳动者有权获得应得的病假工资以及可能的赔偿。
总结来说，病假期间工资全扣是违法的。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取合适的措施来维护自己的合法权益。同时，用人单位也应遵守相关法律法规，确保病假工资的合理支付，避免引发不必要的法律纠纷。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。