病假工资全扣一般是不合法的，但具体是否合法需根据具体情况判断，关键在于扣款行为是否符合法律规定及劳动合同约定，且扣款后工资不得低于当地最低工资标准的80%。以下是对此问题的详细分析：
合法情形
符合法定标准：
- 根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第59条规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，该费用可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。若企业按照这一标准支付病假工资，即使看似“扣减”，但实际上是合法的，因为并未低于法定最低标准。
劳动合同或规章制度约定：
- 如果劳动合同中明确规定了病假期间的工资支付方式，如病假期间工资为正常工资的某一比例，且该比例不低于当地最低工资标准的80%，那么按照合同约定执行是合法的。
- 同样，若单位依法制定的规章制度中明确规定了病假工资的支付标准，且该标准不低于法定最低标准，同时规章制度的制定经过了民主程序并向劳动者公示，那么按照规章制度执行也是合法的。
不合法情形
低于法定标准：
- 如果企业扣减病假职工的工资低于当地最低工资标准的80%，则这种行为是不合法的。例如，员工正常工资为5000元，当地最低工资标准为2000元，若企业扣减后员工病假工资低于1600元（2000元的80%），则不合法。
无规章制度或未公示、未协商：
- 如果单位没有相关规章制度，或者规章制度的制定未经过民主程序且未向劳动者公示，就随意扣发病假工资，这也是违法的。
- 另外，若劳动合同中未对病假工资进行约定，且单位未与员工协商一致就擅自扣减工资，同样不合法。
无故克扣工资：
- 如果员工请病假期间，公司未按照法律法规或劳动合同约定支付工资，而是无故克扣员工应得的工资（如全勤奖、按事假标准扣工资等），这种行为也是不合法的。
劳动者权益保护与维权途径
证据收集：
- 劳动者应妥善保存劳动合同、病假证明、工资条或银行流水等记录，作为维权时的关键证据。
协商与投诉：
- 首先尝试与用人单位进行沟通协商，要求纠正不合法的扣款行为。
- 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并处理。
劳动仲裁与诉讼：
- 如劳动监察部门未能解决问题，劳动者可依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 对仲裁裁决不服的，还可以在规定时间内向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
综上所述，病假工资全扣是否合法需根据具体情况判断。劳动者在面对不合理的扣款时，应积极采取措施保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。