当员工被诊断出患有甲状腺癌症时，从劳动法的角度来看，公司需要遵循一系列的规定来保障员工的权益。以下是对此问题的详细解答：
一、医疗期保护
医疗期的确定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病（包括甲状腺癌症）需要停止工作接受医疗时，享有医疗期。医疗期的具体期限根据员工的实际参加工作年限和在本单位的工作年限来确定，一般为3至24个月不等。对于某些特殊疾病，如癌症，若在规定的医疗期内未能痊愈，经企业和当地劳动部门批准，医疗期还可以适当延长。
医疗期内的待遇：
- 在医疗期内，公司需按照劳动合同的约定或国家相关规定支付病假工资或疾病救济费，且该费用不得低于当地最低工资标准的80%。
- 员工在医疗期内享有治疗、休养的权利，公司不得随意解除劳动合同，否则将构成违法解除，需要承担相应的法律责任。
二、劳动合同的处理
劳动合同期满的处理：
- 若员工在劳动合同期满时仍处于医疗期内，劳动合同应自动续延至医疗期满，以确保员工在医疗期间内的权益不受影响。
劳动合同的解除：
- 医疗期满后，若员工不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作，公司可以提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并依法支付经济补偿金。经济补偿金的标准按每满一年支付一个月工资来计算。
- 需要注意的是，如果员工曾有癌症患病史但已痊愈，并在工作中未出现不胜任岗位的情形，公司不得以员工曾患癌症为由解除劳动合同。
三、劳动能力鉴定及后续安排
劳动能力鉴定：
- 医疗期满后，员工可以申请劳动能力鉴定，以评估其劳动功能障碍程度和生活自理障碍程度。这将有助于公司了解员工的实际工作能力，为后续的工作安排提供依据。
后续工作安排：
- 根据劳动能力鉴定结果，对于部分丧失劳动能力的员工，公司应调整工作岗位，安排力所能及的工作；对于完全丧失劳动能力的员工，如果符合国家退休、退职条件的，应按规定办理相关手续。
四、其他权益保障
社会保险：
- 公司应依法为员工缴纳社会保险，包括基本医疗保险等。员工患甲状腺癌症产生的医疗费用可以按当地医保政策进行报销，减轻经济负担。
禁止就业歧视：
- 根据《中华人民共和国就业促进法》的相关规定，公司不得以员工曾患癌症为由拒绝录用或解除劳动合同，这是对员工就业权益的保障。
救助与支持：
- 员工还可以向工会等组织反映情况，争取困难职工帮扶等相关政策的救助和支持，以度过难关。
五、争议解决途径
如果公司违反劳动法规定，员工可以向劳动监察部门投诉或通过劳动仲裁、诉讼等途径来维护自己的权益。
综上所述，当员工被诊断出患有甲状腺癌症时，公司应严格遵守劳动法的相关规定，给予员工必要的医疗期和相应的待遇。在医疗期内不得随意解除劳动合同，医疗期满后若员工无法继续工作，应依法处理劳动合同的解除事宜并支付经济补偿金。同时，公司应关注员工的劳动能力鉴定结果，合理安排后续工作，并确保员工的社会保险权益得到保障。