针对您提出的“调查工程项目违法分包转包由哪个部门负责”的问题，我可以明确地告诉您，这一行为的调查与处理涉及多个部门，具体取决于工程项目的类型和所在领域。以下是从不同角度为您详细分析的解答：

1. 一般工程项目（如房屋建筑、市政基础设施等）

   • 主管部门：住房和城乡建设主管部门（如住建局、建设局）
   • 职责：作为工程建设活动的主要监督管理部门，住房和城乡建设主管部门对各类房屋建筑和市政基础设施工程中的违法分包、转包行为具有全面的监管职责。
   • 处理措施：依据《建设工程质量管理条例》等相关法规，该部门可责令改正，没收违法所得，并处以工程合同价款百分之零点五以上百分之一以下的罚款；情节严重时，还可责令停业整顿，降低资质等级，甚至吊销资质证书。

2. 交通建设工程（如公路、桥梁、港口码头等）

   • 主管部门：交通运输主管部门（如交通运输局）
   • 职责：负责公路、水运等交通建设工程中的违法分包、转包行为监管。
   • 处理措施：根据《公路建设市场管理办法》等相关规定，违法分包、转包行为将面临10万元以上50万元以下的罚款；情节严重者，将被限制1年至2年内不得进入公路建设市场。

3. 水利工程建设项目（如水库、河道治理等）

   • 主管部门：水利主管部门（如水利局）
   • 职责：承担水利工程建设项目的监督管理职责，包括水库、河道治理等项目中的违法分包、转包现象。
   • 处理措施：依据《水利建设市场主体信用信息管理办法》等相关规定，违法分包、转包主体将受到信用惩戒等处理，并可能面临罚款、责令整改等具体行政处罚。

4. 涉及招投标环节的违规行为

   • 主管部门：发展和改革部门（发改委）
   • 职责：如果违法分包、转包行为涉及到招投标环节的违规，可向发改委反映情况。发改委负责指导和协调本地区招投标工作，对重大建设项目建设过程中的工程招投标活动实施监督检查，并有权对违规行为进行调查处理。

5. 特殊情况（如涉及公职人员违纪违法）

   • 主管部门：纪委监委
   • 职责：针对公职人员在工程违法分包、转包中的违纪违法行为进行监督、调查和处置。
   • 处理原则：根据《中国共产党纪律处分条例》《中华人民共和国监察法》等，对违纪违法公职人员给予相应处分，涉嫌犯罪者依法移送司法机关。

建议与提醒：

• 在发现违法分包、转包行为时，建议您首先收集并保留好相关证据，如合同、图纸、交易记录等能证明违法行为的材料。
• 根据工程项目的类型和所在领域，选择向相应的主管部门进行投诉或举报。
• 如果您不确定应该向哪个部门投诉或举报，或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。