工程转包行为主要由以下几个部门负责查处：

1. 建设行政主管部门

   • 主要职责：作为建设工程领域的主要监管部门，建设行政主管部门负责全面监督建筑市场活动，包括查处工程转包、违法分包等违法行为。
   • 举报途径：您可以通过官方网站举报信箱、举报电话（如12319服务热线）或现场举报的方式，向建设行政主管部门反映工程转包问题。
   • 处理措施：依据《建设工程质量管理条例》等相关法规，建设行政主管部门会对违法转包行为进行认定和处罚，包括但不限于责令改正、没收违法所得、罚款、降低资质等级，直至吊销资质证书。

2. 交通运输主管部门

   • 针对范围：如果工程转包行为发生在交通基础设施建设工程（如公路、桥梁等）领域，那么交通运输主管部门将是主要的监管和查处部门。
   • 举报方式：您可以拨打12328交通运输服务监督电话，或直接向当地交通运输局的工程管理科室反映工程转包问题。
   • 处理措施：根据《公路建设市场管理办法》，交通运输主管部门会对违法单位进行责令限期改正、警告、罚款等处罚，情节严重者还会限制其进入交通建设市场。

3. 水利部门

   • 监管范围：对于水利工程建设项目，水利部门是负责监督管理的部门。
   • 举报渠道：如果您发现水利工程建设项目中存在工程转包行为，可以向当地水利局的水利工程建设管理部门举报，或通过水利部12314监督举报服务平台进行反映。
   • 法律依据与处理：水利部门会依据《水利工程建设项目施工分包管理规定》等法规，对违法转包行为进行调查处理，并给予警告、罚款、禁止参与投标等处罚。

4. 纪委监委

   • 特殊职责：如果工程转包行为中涉及公职人员的违纪违法行为，那么纪委监委将负责监督、调查和处置。
   • 举报方式：您可以通过纪委监委的官方举报网站、举报电话12388或信访部门进行举报。
   • 处理原则：纪委监委会根据《中国共产党纪律处分条例》《中华人民共和国监察法》等法规，对违纪违法公职人员给予相应处分，涉嫌犯罪者还会依法移送司法机关。

在举报工程转包行为时，建议您准备以下材料：

• 转包合同或协议复印件；
• 支付凭证、银行流水等财务记录；
• 施工现场的照片、视频等直观证据；
• 相关人员的证言或书面陈述；
• 其他能够证明违法转包行为的材料。

法律分析与建议： 工程违法转包不仅扰乱了建筑市场秩序，还严重威胁到工程质量安全和人民群众的生命财产安全。因此，积极举报并配合相关部门查处此类违法行为，是维护建筑市场公平竞争、保障工程质量的重要举措。如果您发现了工程转包行为，不要犹豫，及时向相关部门举报，并提供详尽的证据和情况说明，以协助相关部门更好地了解和查处违法行为。

如果您在举报过程中遇到任何问题，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。作为专业律师，我将竭诚为您提供法律支持。