结论：公司使用员工办理营业执照的行为是否合法，需根据具体情况判断，一般而言，若员工是作为公司代表合法办理，且符合相关法律法规及公司章程规定，则是合法的；但若存在冒用、盗用员工身份或违反法律法规等情形，则是不合法的。

详细分析：

1. 合法情形：

   • 公司授权代表：如果公司正式授权某员工作为其代表，去办理营业执照的相关手续，并且该员工在办理过程中遵循了所有相关的法律法规和公司章程的规定，那么这种行为是合法的。例如，公司可能因为某些原因（如法定代表人无法亲自到场）而需要指定一名员工作为其代理人去办理营业执照，这种情况下，只要代理行为合法合规，就没有问题。
   • 符合公司章程和内部规定：如果公司章程或内部规定中明确允许或规定了员工可以代表公司办理营业执照等事宜，并且该员工在办理时遵循了这些规定，那么这种行为也是合法的。

2. 不合法情形：

   • 冒用、盗用身份：如果公司未经员工同意，擅自使用其身份信息去办理营业执照，或者员工在不知情的情况下被公司利用去办理相关手续，这都属于冒用、盗用身份的行为，是违法的。这种行为不仅侵犯了员工的个人权益，也可能导致公司面临法律责任。
   • 违反法律法规：在办理营业执照的过程中，如果公司或员工违反了相关的法律法规，如提供虚假材料、隐瞒重要事实等，那么这种行为也是不合法的。这可能导致营业执照被撤销，公司面临罚款、吊销营业执照等处罚。

法律建议：

• 对于公司：在办理营业执照时，应确保所有手续合法合规，遵循相关法律法规和公司章程的规定。如果需要指定员工作为代表去办理相关手续，应事先获得员工的明确同意，并确保其了解并同意承担相关责任。
• 对于员工：如果发现自己被公司擅自使用身份信息去办理营业执照等事宜，应及时向公司提出异议，并保留相关证据。如果公司不予理会或处理不当，员工可以向相关部门投诉或寻求法律援助。

可能后果：

• 如果公司或员工的行为被认定为违法，可能会面临法律责任，包括罚款、吊销营业执照、承担民事赔偿责任等。
• 对于员工而言，如果其身份信息被冒用或盗用，还可能对其个人信用记录造成不良影响。

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