结论：跟中介闹僵了但仍在工作，一般情况下中介或用人单位不应因此扣工资，但具体是否扣工资还需根据实际情况来判断。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律角度
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，只要劳动者提供了正常劳动，用人单位就应当支付相应的工资，不受其他非工作相关因素的影响。
扣工资的合法情形：
- 用人单位扣工资通常需要有合法的理由，如劳动者违反规章制度、造成经济损失等，并且需要按照法定程序进行。如果中介或用人单位仅因与劳动者闹僵就扣工资，这通常是不合法的。
中介的角色：
- 如果中介是作为用人单位的代理人或劳务派遣单位，那么它应当遵守劳动法律法规，不得随意扣减劳动者的工资。如果中介违反了这一规定，劳动者有权向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
二、实际情况角度
合同约定：
- 首先，需要查看你与中介或用人单位签订的劳动合同或相关协议中是否有关于工资支付、扣减的条款。如果合同中有明确规定，那么应当按照合同执行。但需要注意的是，合同中的条款不得违反法律法规的强制性规定。
中介的行为：
- 如果中介仅因个人情绪或与你的关系问题而扣工资，这是不合理的。你可以尝试与中介沟通，明确表达你的权益和诉求，要求其按照合同和法律规定支付工资。
用人单位的态度：
- 如果中介是代表用人单位与你签订合同或进行管理的，那么用人单位的态度也很重要。你可以与用人单位沟通，说明情况，要求其介入处理中介的不当行为。
三、建议与措施
保留证据：
- 无论与中介还是用人单位沟通，都应当保留好相关证据，如工资条、劳动合同、沟通记录等。这些证据在后续维权过程中将起到重要作用。
寻求帮助：
- 如果与中介或用人单位沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，并保护劳动者的合法权益。
考虑法律途径：
- 如果情况严重，你也可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。例如，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
总结与进一步思考：跟中介闹僵了但仍在工作，一般情况下不应因此扣工资。但具体是否扣工资还需根据合同约定、实际情况以及法律法规来判断。如果你遇到了这种情况，建议先与中介和用人单位沟通，明确表达你的权益和诉求。如果沟通无果，再考虑寻求法律帮助或采取法律途径来维护自己的权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。