关于中介预支工资后发工资是否会扣的问题，这主要取决于中介与劳动者之间的具体约定以及相关法律法规的规定，以下分情况讨论：
若中介与劳动者有明确约定：
- 如果中介在预支工资时，与劳动者明确约定了预支工资的扣除条件、方式及时间等，并且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么中介在发工资时按照约定进行扣除是合法的。例如，双方约定预支工资需在后续工资中分期扣除，且扣除比例合理，这样的约定是有效的。
若中介与劳动者无明确约定或约定违法：
- 如果中介与劳动者之间没有明确的约定，或者约定违反了法律法规的强制性规定（如约定扣除比例过高、扣除条件不合理等），那么中介在发工资时无权随意扣除预支工资。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者有权获得其应得的劳动报酬，中介不得无故克扣或拖欠。
中介行为涉嫌违法的情况：
- 如果中介以预支工资为名，实际上是在变相收取押金、保证金或其他费用，并且这些费用在劳动者离职时未予退还，或者中介在发工资时无故扣除大量预支工资，导致劳动者实际获得的劳动报酬低于法定标准或约定标准，那么中介的行为可能涉嫌违法。在这种情况下，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
法律建议：
- 明确约定：劳动者在与中介签订劳动合同时，应明确约定预支工资的扣除条件、方式及时间等，以避免后续产生纠纷。
- 保留证据：劳动者应妥善保管与中介之间的所有书面协议、聊天记录、转账记录等证据，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
- 及时维权：如果劳动者发现中介存在无故克扣或拖欠工资的行为，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果中介违反约定或法律法规扣除预支工资，劳动者有权要求中介补发被扣除的工资，并可能获得相应的经济补偿或赔偿。
- 如果中介的行为构成违法，还可能面临劳动监察部门的处罚或法律诉讼的风险。
总结：中介预支工资后发工资是否会扣，取决于双方之间的约定以及相关法律法规的规定。劳动者应明确约定、保留证据并及时维权，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。