结论前置：中介预支工资扣手续费是否合法，需分情况讨论。一般来说，若手续费扣除有合法依据且合理，则可能合法；若无合法依据或扣除不合理，则不合法。以下从不同角度详细分析：
一、合法依据的角度
双方约定：
- 如果劳动者与中介在签订劳动合同时或预支工资前，明确约定了预支工资时可以扣除一定比例的手续费，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种扣除是合法的。
- 例子：劳动者与中介签订合同，约定预支工资时扣除5%作为手续费，且该约定不违反其他法律规定，则扣除合法。
法律法规：
- 目前，并没有直接的法律法规明确规定中介预支工资时是否可以扣除手续费。但是，如果扣除的手续费实际上构成了对劳动者劳动报酬的非法克扣或变相克扣，那么这种扣除就是违法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”虽然该条款未直接提及预支工资和手续费，但“不得克扣工资”的原则同样适用于预支工资的情况。
二、合理性的角度
手续费比例合理：
- 即使双方约定了可以扣除手续费，但如果手续费的比例过高，超出了合理范围，也可能被视为不合法。合理的手续费比例应考虑到中介的实际成本和服务内容。
- 判断标准：一般来说，手续费比例应与中介提供的服务成本相匹配，且不应显著高于市场平均水平。
手续费用途合法：
- 扣除的手续费必须用于合法目的，如支付中介服务费用等。如果手续费被用于非法目的，如中介个人的非法获利，那么这种扣除就是违法的。
三、特殊情况
- 中介未提供实际服务：
- 如果中介在预支工资时扣除了手续费，但实际上并未为劳动者提供任何服务或提供的服务与扣除的手续费不成比例，那么这种扣除也是违法的。
法律建议
审查合同：
- 劳动者在签订劳动合同时或预支工资前，应仔细审查合同条款，特别是关于预支工资和手续费的约定。如果发现不合法或不合理的条款，应及时与中介协商修改或拒绝签订。
保留证据：
- 劳动者应保留好与中介签订的合同、预支工资的凭证以及任何与手续费扣除相关的沟通记录等证据。以便在发生纠纷时，能够证明自己的权益。
寻求法律帮助：
- 如果劳动者认为中介扣除的手续费不合法或不合理，可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为你提供进一步的法律咨询和协助。
总结：中介预支工资扣手续费是否合法，取决于双方是否有合法约定、手续费比例是否合理以及手续费用途是否合法等因素。劳动者在遇到此类情况时，应仔细审查合同条款、保留好相关证据，并在必要时寻求法律帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。