劳动合同中约定含加班费在一定条件下是合法的，但必须符合相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细分析：
合法的情况
依法足额支付且不低于法定标准：
- 用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定工资包含加班费，且实际支付给劳动者的工资总额中已按法定加班工资计算标准（即工作日加班不低于工资的150%、休息日加班不低于工资的200%、法定休假日加班不低于工资的300%）足额支付了加班费用。
- 劳动者的实际收入未因这种约定而减少，且不低于当地最低工资标准和法定加班工资计算标准。例如，若劳动者月工资为5000元，其中包含加班费，且经核算，其加班费部分已按照法定标准支付，那么这种约定是合法的。
明确约定且符合法规：
- 劳动合同中应明确约定加班工资的具体数额、计算方式以及支付标准。例如，可以约定“月工资5000元，其中包含每月最多XX小时的加班费，加班费按照每小时XX元计算”。
- 劳资双方约定的加班薪酬应是劳动者总工资收入的一部分，同时还应包括计时工资、计件酬金、津贴奖励等福利。
- 折算后正常工作时间工资不得低于当地最低工资标准。这是为了保障劳动者的基本生活需求。
不合法的情况
违反法律强制性规定：
- 若劳动合同中的约定导致用人单位在正常工资中变相压低基本工资，或在加班时以“已包含加班费”为由拒绝按法定标准支付，则违反了法律的强制性规定，此种约定不合法。
- 加班时间的不确定性不影响加班费作为额外报酬的性质，因此不能简单地将加班费包含在固定工资中，而忽视了对加班时间的合理计算和支付。
未明确加班工资数额和计算方式：
- 如果劳动合同中虽然约定了工资包含加班费，但未具体说明加班工资的计算基数、计算方式及支付标准，或者约定的加班工资低于法定标准，这种约定可能被视为无效。例如，若合同仅约定“月工资包含加班费”，但未明确加班费的具体数额和计算方式，那么这种约定在发生争议时可能无法得到法律的支持。
建议
- 明确约定：为避免后续纠纷，建议用人单位和劳动者在签订劳动合同时，务必明确约定加班工资的计算基数、计算方式、支付标准等内容，并确保这些约定完全符合法律法规的要求。
- 充分沟通：双方应充分沟通，确保劳动者对合同条款有清晰理解，以保障双方的合法权益。劳动者在签订合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资和加班费的约定，如有疑问应及时向用人单位提出。
- 保留证据：用人单位应妥善保存考勤记录、工资支付凭证等证据材料，以便在必要时证明其已经依法支付了加班费。劳动者也应保留好自己的工资条、考勤记录等证据，以备不时之需。
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