当公司因违法犯罪行为被查处后，对于后续无关员工的处理，需分情况讨论，以下是具体分析：
员工与违法行为无关的情况
- 劳动关系存续：若员工未参与公司违法活动，且公司未被依法解散或注销，劳动关系原则上继续存续。员工应正常出勤、履行工作职责，公司需按时支付工资、缴纳社保。
- 工资与补偿：若公司因调查暂停经营导致员工待岗，需按当地规定支付待岗工资（通常不低于最低工资标准的80%）。若公司最终破产或解散，员工可依据《劳动合同法》第44条、46条主张经济补偿（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。
- 离职自由：员工有权随时提出离职，且无需因公司被查处而承担任何责任。若公司拖欠工资或未缴社保，员工可依据《劳动合同法》第38条主张被迫离职，并要求支付经济补偿。
员工可能被牵连的情况
- 配合调查义务：若员工被要求协助调查（如提供证言、资料），需依法配合，但享有拒绝自证其罪的权利（不得被强迫承认自己未参与的违法行为）。
- 错误处理的风险：若公司或执法机关错误认定员工参与违法活动，员工可提出异议：
- 内部申诉：向公司人力资源部门或管理层说明情况，要求纠正错误处理；
- 行政复议/诉讼：若被行政处罚（如罚款、拘留），可依法申请行政复议或提起行政诉讼；
- 刑事辩护：若被刑事立案，可委托律师进行无罪辩护或争取从轻处理。
公司破产或解散时的员工权益
- 债权申报：若公司进入破产程序，员工工资、经济补偿、社保欠缴等属于优先债权，需在法院规定的期限内申报；
- 社保转移：公司需为员工办理社保减员手续，员工可自行续缴或由新单位接续；
- 再就业支持：员工可向当地人社部门申请失业登记，符合条件的可领取失业保险金或享受再就业培训服务。
建议行动步骤：
- 保留劳动合同、工资条、考勤记录等证据，以证明自身与违法活动无关；
- 若被要求配合调查，先咨询律师再回应，避免言辞不当被误读；
- 关注公司动态，若发现破产或解散迹象，及时申报债权或转移社保；
- 若权益受损，优先通过协商、投诉解决，必要时启动法律程序。
如有进一步疑问（如具体地区补偿标准、调查程序细节等），可直接向我咨询，我会结合您的实际情况详细解答。