公司是否可以不批准员工复职，需分情况讨论，关键在于“停薪留职”的性质及双方约定。具体分析如下：

1. 若“停薪留职”是双方协商一致的结果（如书面协议）

• 公司有权拒绝复职：若停薪留职协议中明确约定了期限（如1年）、复职条件（如提前30天申请）或公司保留是否同意复职的权利，则公司可根据协议条款决定是否批准。例如，协议约定“员工停薪留职期满后，公司有权根据岗位需求决定是否安排复职”，此时公司拒绝复职不违法。
  
• 法律依据：根据《劳动合同法》第35条，劳动合同变更需双方协商一致。停薪留职协议属于劳动合同的变更，若协议已明确复职规则，双方均需遵守。

2. 若“停薪留职”是公司单方安排（如强制停薪留职）

• 公司无权拒绝复职：若公司未经员工同意，单方强制要求停薪留职（如以“经营困难”为由直接通知员工停薪留职），则属于违法变更劳动合同。员工有权要求恢复原岗位工作，公司拒绝复职可能构成违法解除劳动合同，需支付赔偿金（2N）。
  
• 例外情形：若公司因客观原因（如疫情、停产整顿）需临时停工，可依据《工资支付暂行规定》第12条支付生活费，但需与员工协商一致，且停工期限届满后应恢复工作。

3. 若停薪留职期满后员工未及时申请复职

• 公司可按旷工处理：若协议约定“员工需在停薪留职期满前X日申请复职，逾期未申请视为自动离职”，而员工未履行申请义务，公司可依据规章制度解除劳动合同，无需支付补偿。
  
• 风险提示：公司需证明已将协议条款明确告知员工（如签字确认），否则可能被认定为违法解除。

操作建议

1. 对员工：

   • 签订停薪留职协议时，务必明确复职条件、期限及违约后果，避免口头约定；
     
   • 若公司拒绝复职，可要求出具书面理由，并保留协议、沟通记录等证据，必要时申请劳动仲裁。
     

2. 对公司：

   • 制定停薪留职制度时，需经职工代表大会讨论并公示，确保程序合法；
     
   • 拒绝复职时，需依据协议或规章制度，避免单方强制操作。
     

总结：公司能否拒绝复职，核心在于停薪留职是否经双方协商一致及协议条款的约定。若您遇到具体纠纷，可提供协议文本或事件细节，我将进一步分析。