结论：公司不可以单纯因为员工怀孕就给予低绩效评价。绩效评价应当基于员工的工作表现、工作成果等客观因素，而非员工的个人生理状况。
分析角度一：法律对怀孕员工的保护
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国妇女权益保障法》等相关法律法规，女职工在孕期、产期、哺乳期内享有特殊的劳动保护，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。绩效评价作为员工工资、奖金、晋升等的重要依据，如果公司因为员工怀孕而给予低绩效评价，实际上可能构成了对怀孕员工的歧视，违反了相关法律法规。
分析角度二：绩效评价的客观性和公正性
绩效评价应当是一个客观、公正的过程，它应当基于员工的工作表现、工作成果、工作能力等客观因素进行。怀孕是员工的个人生理状况，与员工的工作表现没有直接关系。因此，公司不能将怀孕作为评价员工绩效的负面因素。如果公司因为员工怀孕而给予低绩效评价，这不仅违反了法律法规，也损害了绩效评价的客观性和公正性。
分析角度三：公司的责任和义务
作为用人单位，公司有责任和义务为员工提供一个公平、公正的工作环境，保障员工的合法权益。这包括保障怀孕员工的特殊劳动保护权益，不得因怀孕而给予不公平的待遇。如果公司因为员工怀孕而给予低绩效评价，这实际上是对公司责任和义务的忽视和违反。
建议：
公司应完善绩效评价制度：公司应当建立科学、合理、公正的绩效评价制度，明确评价标准和流程，确保评价过程客观、公正、透明。同时，公司应当加强对评价人员的培训和管理，提高他们的专业素养和公正意识。
公司应尊重怀孕员工的权益：公司应当尊重怀孕员工的特殊生理状况，给予她们必要的关怀和支持。在绩效评价过程中，公司应当避免将怀孕作为负面因素考虑在内，确保怀孕员工能够享受到公平、公正的待遇。
员工应了解自己的权益：怀孕员工应当了解自己的权益和法律法规的保护范围，如果公司因为怀孕而给予不公平的待遇，员工可以依法维护自己的合法权益。
如果公司存在因为员工怀孕而给予低绩效评价的情况，员工可以向公司提出异议，并要求公司重新进行绩效评价。如果公司拒绝改正或者处理不当，员工可以向劳动监察部门投诉或者寻求法律援助。有问题可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。