结论：公司让员工每天上十二个小时班，在一般情况下是不合法的。但在某些特殊情况下，如经劳动行政部门批准的综合计算工时工作制或不定时工作制，以及符合法律规定的加班和紧急情况处理下，可能合法。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般情况下的不合法性

根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家明确实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是保障劳动者休息权和健康权的基本法律要求。因此，在常规情况下，要求员工每天工作12小时显然超出了法定的每日工作时间上限，构成违法行为。

二、特殊情况下的合法性分析

1. 综合计算工时工作制：

   • 部分企业因工作性质特殊，如连续作业或受季节及自然条件限制，可采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的工时制度。
   • 在此制度下，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时，但综合计算周期内的总实际工作时间不得超过总法定标准工作时间（例如，一个月约为167小时）。
   • 企业实行此类工时制需经过劳动行政部门的审批，否则仍属违法。

2. 不定时工作制：

   • 对于企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员等因工作无法按标准工作时间衡量的职工，可实行不定时工作制。
   • 在此制度下，企业可不执行每日工作不超过8小时的规定，但也需经过劳动行政部门审批。

3. 加班的合法性：

   • 用人单位因生产经营需要，可与工会和劳动者协商后延长工作时间，但一般每日不得超过1小时；特殊原因下每日不得超过3小时，且每月不得超过36小时。
   • 超出此范围的加班均属违法，即使与劳动者协商一致也不能违反法律规定。若公司要求员工每天工作12小时，且未按照法律规定支付加班费或未经过相应审批程序，则属于违法行为。

4. 紧急情况下的例外：

   • 在自然灾害、事故或其他紧急情况威胁劳动者生命健康和财产安全时，为紧急处理而延长工作时间不受上述限制。
   • 但这种情况较为罕见，且必须严格遵守法律规定，确保劳动者的安全和健康。

三、法律责任与救济途径

• 若用人单位违法安排劳动者延长工作时间，劳动者可向劳动行政部门投诉，由劳动行政部门给予警告、责令改正，并可处以罚款。
• 同时，劳动者有权要求用人单位支付相应的加班工资。根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。若公司未支付加班费，劳动者可依法要求公司支付。
• 若公司存在其他违法行为，如低于当地最低工资标准支付工资等，劳动者也可依法维护自己的权益。

四、建议

• 对于公司而言，应严格遵守法律法规，合理安排员工的工作时间和休息时间，保障劳动者的合法权益。若因工作需要延长工作时间，应确保符合法律规定并经过相应审批程序。
• 对于员工而言，若遇到公司违法安排延长工作时间的情况，可先与公司协商解决；若协商无果，可向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。