单位在流程未走完时可以拒绝伤残鉴定申请，但需分情况讨论，具体如下：

1. 若流程未走完属于法定或合同约定的前置条件
   根据《工伤保险条例》及《人体损伤致残程度分级》规定，伤残鉴定需以“治疗终结”为前提。若单位要求完成医疗期、提交完整病历等流程，属于合理拒绝。例如：

   • 员工未完成康复治疗，可能影响伤残等级评定结果；
     
   • 合同或单位规章制度明确约定“需先提交工伤认定决定书后再申请鉴定”，此时单位拒绝具有合法性。

2. 若流程未走完无合理依据或违反法定程序
   若单位以内部审批拖延、未明确告知流程等非必要理由拒绝，可能构成违法。例如：

   • 员工已提交完整材料，单位仅以“领导未签字”为由拒绝；
     
   • 超出《工伤保险条例》规定的30日工伤认定申请期限后，仍拒绝配合鉴定。
     此时员工可向劳动监察部门投诉，或通过劳动仲裁要求单位履行义务。

关键建议：

• 员工应先确认单位要求的流程是否符合法律规定（如治疗终结、工伤认定等前置条件）；
  
• 若流程合法但单位故意拖延，可书面催告并留存证据；
  
• 若流程本身违法，可直接申请劳动仲裁或向社保部门投诉。
  

如有具体案例细节（如单位拒绝理由、流程阶段等），可进一步向我咨询，我会结合实际情况分析法律风险。