针对市场监管部门发出询问通知书后企业不来的情况，可以采取以下措施：
再次通知与催告：
- 市场监管部门可以首先尝试通过电话、邮件或其他书面方式再次通知企业，明确告知其未按时配合调查的法律后果，并给予一定的宽限期，要求其在规定时间内前来接受询问或提供相关材料。
现场检查与强制措施：
- 若企业仍不配合，市场监管部门有权依据相关法律法规，如《市场监督管理行政处罚程序规定》等，对企业进行现场检查。在现场检查过程中，如果发现企业存在违法行为或相关证据，可以依法采取查封、扣押等强制措施，以确保调查的顺利进行。
行政处罚与公告：
- 对于拒不配合调查的企业，市场监管部门可以依法对其作出行政处罚决定，如罚款、吊销营业执照等。同时，为了维护市场秩序和公平竞争环境，市场监管部门还可以将企业的违法行为及处罚情况向社会公告，以起到警示作用。
申请法院强制执行：
- 如果企业拒不履行市场监管部门作出的行政处罚决定，市场监管部门可以依法向人民法院申请强制执行。法院将依法审查并作出裁定，对拒不履行的企业采取强制措施，如冻结银行账户、划拨资金等，以确保行政处罚决定的执行。
法律责任与后果：
- 企业应当明确，拒不配合市场监管部门的调查不仅可能面临行政处罚，还可能对其声誉和信用造成严重影响。在严重情况下，甚至可能构成犯罪，需要承担刑事责任。因此，企业应当积极配合市场监管部门的调查工作，如实提供相关材料和信息。
法律背景与建议：
- 市场监管部门在履行职责过程中，有权依法对涉嫌违法的企业进行调查和询问。企业作为市场主体，应当遵守相关法律法规，积极配合市场监管部门的调查工作。
- 如果企业因特殊原因无法按时配合调查，应当及时向市场监管部门说明情况，并申请延期或提供其他便利条件。避免因拒不配合而引发不必要的法律后果。
- 在实际操作中，市场监管部门应当严格按照法定程序进行调查和询问，确保企业的合法权益不受侵害。同时，企业也应当了解自己的权利和义务，积极维护自身合法权益。
后续行动建议：
- 如果您作为市场监管部门的工作人员遇到此类情况，建议首先与企业进行沟通协商，明确告知其法律责任和后果。
- 如果企业仍不配合，可以依法采取上述措施进行调查和处理。同时，注意保留相关证据和记录，以备后续法律程序使用。
- 如果您是企业负责人或相关人员，遇到市场监管部门的询问通知书时，请务必积极配合调查工作，如实提供相关材料和信息。如有任何疑问或需要帮助，请随时向我咨询。