针对您提出的“擅自改变房屋用途应该如何整改”的问题，这是一个涉及法律法规和行政监管的重要事项，以下是我为您提供的详细解答：
一、明确擅自改变房屋用途的法律后果
擅自改变房屋用途，即未经相关部门批准，擅自变更房屋原设计或经批准的用途，是违法的行为。这种行为可能会面临责令限期改正、罚款、恢复原状、吊销相关证照等法律后果，并且还可能对房屋的产权和使用权造成长远影响，如影响房屋转让、出租或申请抵押贷款等。
二、整改措施与步骤
立即停止违规行为：
- 一旦发现擅自改变了房屋用途，应立即停止所有相关的违规活动，避免进一步扩大影响或造成更严重的后果。
咨询相关部门：
- 联系当地的房地产管理部门、规划部门或城市管理部门，了解具体的违规情况和整改要求。这些部门会根据相关法律法规，给出具体的整改指导和期限。
制定整改方案：
- 根据相关部门的指导，制定详细的整改方案。方案应包括恢复房屋原用途的具体措施、时间表、所需材料等。如果改变用途涉及房屋结构或消防安全的改动，整改方案还需特别考虑这些方面的恢复。
实施整改：
- 按照整改方案，逐步实施整改措施。这可能包括拆除擅自搭建的设施、恢复原本规划布局、修复因改变用途而造成的损坏等。
申请验收：
- 整改完成后，向相关部门申请验收。验收合格后，相关部门会出具整改合格证明或相关文件，确认房屋已恢复原用途。
补办合法手续（如适用）：
- 如果您有合理需求希望合法改变房屋用途，应在整改完成后，向相关部门申请补办手续。提交申请材料并经批准后，您可以合法变更房屋用途。
三、注意事项
- 积极配合调查：如果被相关部门查处，应积极配合调查，如实说明情况，接受罚款、整改等处罚措施，并及时纠正错误行为。
- 避免类似行为再次发生：在整改完成后，应严格遵守相关法律法规，避免再次擅自改变房屋用途，以免面临更严重的法律后果。
- 维护自身权益：如果擅自改变房屋用途的行为影响到您的合法权益，如相邻权、使用权等，您可以通过协商、发送律师函或提起民事诉讼等途径维护自身权益。
四、总结与建议
擅自改变房屋用途是违法的行为，不仅可能面临严重的法律后果，还可能对房屋的长期价值和使用造成不利影响。因此，我建议您在改变房屋用途前务必咨询相关部门并获得合法审批。如果已经擅自改变了房屋用途，应尽快采取整改措施恢复房屋原状，并补办合法手续（如适用），以避免不必要的法律风险和经济损失。