结论：化工职业员工未离职时，因体检问题解除合同，协议是否无效需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：

一、协议无效的法定情形

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同（包括解除合同的协议）在以下情形下可能被认定为无效：

1. 无民事行为能力人实施的：如果签订协议的一方是无民事行为能力人（如精神病人），则该协议无效。
2. 虚假意思表示实施的：如果双方签订协议时并非真实意思表示，例如存在欺诈、胁迫等情形，导致一方在违背真实意愿的情况下签订了协议，那么该协议可能被撤销或认定为无效。
3. 违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗的：如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗（如公共道德、社会秩序等），则该协议无效。

二、体检与解除合同协议的关系

在化工职业中，体检通常是为了确保员工身体健康，能够胜任工作，并防止职业病的发生。如果员工未离职，但因体检结果不符合工作要求，双方协商解除合同并签订了协议，那么该协议的效力取决于以下因素：

1. 体检结果的合法性与合理性：如果体检是由具有合法资质的医疗机构进行，且体检结果真实反映了员工的健康状况，那么基于该体检结果签订的解除合同协议通常是有效的。但如果体检过程存在违法或不合理之处（如体检机构无资质、体检项目不合法等），则可能影响协议的效力。
2. 协议签订过程的合法性：如果双方在签订协议时，遵循了平等、自愿、公平的原则，且没有欺诈、胁迫等情形，那么该协议是有效的。但如果存在上述违法情形，则协议可能被撤销或认定为无效。
3. 协议内容的合法性：协议内容应符合法律、行政法规的规定，且不得违背公序良俗。如果协议中存在违法或不合理的内容（如要求员工支付高额违约金、剥夺员工合法权益等），则该部分内容可能被认定为无效。

三、特殊情况下的协议效力

1. 职业病诊断与鉴定：如果员工怀疑自己患有职业病，且尚未经过职业病诊断与鉴定程序，那么在此情况下签订的解除合同协议可能存在争议。因为职业病诊断与鉴定是确定员工是否患有职业病的重要依据，如果未经诊断与鉴定就签订协议，可能损害员工的合法权益。
2. 劳动合同法的特殊规定：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在解除劳动合同时，应遵循法定程序和条件。如果用人单位未按照法定程序和条件解除劳动合同，或者解除劳动合同的理由不合法，那么员工有权要求用人单位继续履行劳动合同或支付赔偿金。在这种情况下，即使双方签订了解除合同协议，该协议也可能因违反法律规定而被认定为无效。

四、建议与措施

1. 审查协议内容：在签订解除合同协议前，双方应仔细审查协议内容，确保协议内容合法、合理且符合双方真实意思表示。
2. 咨询专业律师：如果双方对协议效力存在争议或不确定如何签订协议，建议咨询专业律师以获取法律意见和帮助。
3. 保留相关证据：在签订协议过程中，双方应保留好相关证据（如体检报告、协商记录等），以备在发生争议时作为证据使用。

最后，化工职业员工未离职时因体检问题解除合同，协议是否无效需根据具体情况判断。如果双方对协议效力存在争议或不确定如何处理，建议直接向我咨询以获取更具体的法律意见和帮助。