行政机关之间的合同，其性质主要取决于合同的具体内容、签订目的以及双方在合同中的权利义务关系，但通常这类合同若涉及行政管理目标或公共服务提供，可被视为行政合同（又称行政协议）的一种特殊形式或相关联合同。以下是对此问题的详细解析：

一、行政合同的定义与特点

行政合同是行政机关为实现行政管理目标或提供公共服务，与公民、法人或其他组织（在行政机关之间的合同中，另一方通常为另一行政机关或法律、法规授权的组织）经协商一致达成的具有行政法上权利义务内容的协议。它兼具行政性和合同性两大特点：

1. 行政性：行政合同是行政机关行使行政权力、履行行政管理职能的一种方式，其目的在于实现特定的行政管理目标或维护公共利益。
2. 合同性：行政合同又遵循合同的基本原则，如平等、自愿、协商一致等，双方当事人在合同中享有相应的权利并承担相应的义务。

二、行政机关之间合同的特殊性质

当合同双方均为行政机关时，这类合同可能呈现出以下特殊性质：

1. 内部管理或协作合同：如果合同是为了加强行政机关之间的内部管理、协作或资源调配而签订的，如部门间的合作协议、资源共享协议等，这类合同可能更侧重于行政机关之间的内部关系调整，其性质可能更接近于内部行政行为或管理性合同。然而，若这类合同涉及对外部相对人的权利义务影响，则可能仍需遵循行政法的相关规定。
2. 行政协议的一种特殊形式：在某些情况下，行政机关之间的合同可能直接涉及行政管理目标的实现或公共服务的提供，如政府间的合作协议、区域协调发展协议等。这类合同在性质上更接近于行政协议，即双方行政机关作为行政主体，通过协商一致的方式达成具有行政法上权利义务内容的协议。

三、行政机关之间合同的法律适用与争议解决

1. 法律适用：行政机关之间的合同主要受行政法调整，同时也可能涉及民法、经济法等相关法律规定。在合同的订立、履行、变更和解除等方面，应遵循行政法的相关原则和规定。同时，如果合同内容涉及民事权利义务关系，如财产权益的转让、租赁等，则还需适用民法的相关规定。
2. 争议解决：双方行政机关因履行合同发生争议时，通常应通过行政救济方式解决，如行政复议、行政诉讼等。这有助于维护行政机关之间的权威性和稳定性，同时确保争议的公正、高效解决。

四、实际案例与法律建议

实际案例：假设两个行政机关签订了一份关于共同建设某公共设施的协议，协议中明确了双方的投资比例、建设责任、收益分配等事项。这份协议在性质上更接近于行政协议，因为它直接涉及公共设施的建设和管理，旨在实现特定的行政管理目标。

法律建议：

1. 明确合同性质：在签订行政机关之间的合同时，应明确合同的性质和目的，以便确定适用的法律和争议解决方式。
2. 遵循法定程序：合同的订立、履行、变更和解除等应遵循法定程序，确保合同的合法性和有效性。
3. 明确权利义务：在合同中应明确双方的权利义务关系，避免产生争议和纠纷。
4. 寻求专业法律支持：如有需要，可寻求专业律师的法律支持，以确保合同的合法性和合规性。

综上所述，行政机关之间的合同性质主要取决于合同的具体内容、签订目的以及双方在合同中的权利义务关系。在签订和履行这类合同时，应遵循行政法的相关原则和规定，确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律支持，请随时向我咨询。