结论：建筑企业项目合同中的包清工方式，在符合特定条件的情况下，是可以选择简易征收计税方法的。
详细分析：
包清工方式与简易征收的适用性：
- 包清工方式指的是施工方不采购或仅采购辅助材料，主要收取人工费、管理费等费用的建筑服务。根据《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）附件2第一条第（七）项规定，此类服务可选择适用简易计税方法。
- 简易征收计税方法允许建筑企业按照3%的征收率计算缴纳增值税，且不得抵扣进项税额。这种方式在清包工方式下特别适用，因为清包工方式下进项抵扣较少，简易征收可以减轻税负。
简易征收的其他适用条件：
- 除了包清工方式外，简易征收还适用于甲供工程和建筑工程老项目。甲供工程指全部或部分设备、材料由发包方自行采购的建筑工程；建筑工程老项目则是指《建筑工程施工许可证》或承包合同注明的开工日期在2016年4月30日前的项目。
- 如果建筑企业的项目合同符合这些条件之一，也可以选择简易征收计税方法。
简易征收的选择与变更限制：
- 建筑企业在选择简易征收计税方法时，应确保自身符合相关条件，并正确选择计税方法。一旦选择了简易征收方式，在36个月内不得变更计税方法。
- 因此，建筑企业在做出选择前应充分考虑计税方法的简便性、税收负担以及可能的变更限制等因素。
实际操作中的注意事项：
- 在选择简易征收时，建筑企业虽不再需要备案，但仍需准备相关证明资料，如企业营业执照副本、增值税一般纳税人资格证书等，以备税务机关审核。
- 建筑企业应确保自身符合简易征收的条件，并正确选择计税方法，以避免潜在的税务风险。
法律建议：
- 如果建筑企业的项目合同采用包清工方式，且希望减轻税负，可以考虑选择简易征收计税方法。
- 在选择前，应仔细审查项目合同，确保符合简易征收的适用条件。
- 同时，应准备相关证明资料，以备税务机关审核，并确保正确选择计税方法，以避免潜在的税务风险。
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