针对公务员因交通肇事罪被检察院不予起诉后，党纪政务处分的处理方式，结论如下：党纪政务处分仍可能根据具体情节给予，且处分种类和程度需依据相关规定及案件具体情况确定。以下从多个角度进行详细分析：
一、党纪处分方面
处分依据：
- 根据《中国共产党纪律处分条例》的相关规定，党员违反国家法律法规，虽然不构成犯罪但须追究党纪责任的，或者有其他违法行为，损害党、国家和人民利益的，应当视具体情节给予警告直至开除党籍处分。
- 交通肇事罪虽未被起诉，但若存在违反交通法规、造成严重后果或不良影响等情形，仍可能构成党纪处分中的“违法行为”或“其他违法行为”。
处分种类：
- 党纪处分包括警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍等五种。
- 具体处分种类需根据交通肇事行为的严重程度、后果、社会影响以及公务员的认错态度等因素综合考量。
处分程序：
- 党纪处分需经过初步核实、立案审查、审理、作出处分决定等程序。
- 处分决定需经党委（党组）会议集体讨论决定，并报上级党组织批准（如需）。
二、政务处分方面
处分依据：
- 根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》的相关规定，公职人员违反法律、法规、规章以及国家有关规定，应当承担政务责任的，应当给予政务处分。
- 交通肇事行为虽未被起诉，但若违反了交通法规或相关规章制度，且造成了不良后果或影响，仍可能构成政务处分的依据。
处分种类：
- 政务处分包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等六种。
- 具体处分种类需根据交通肇事行为的性质、情节、后果以及公务员的职务、级别等因素确定。
处分程序：
- 政务处分需经过调查取证、初步审定、听取陈述申辩、作出处分决定等程序。
- 处分决定需经任免机关、单位领导成员集体讨论决定，并按照管理权限报批或备案。
三、综合考量因素
行为性质与情节：
- 交通肇事行为的性质（如是否故意、是否严重违反交通法规）和情节（如是否造成人员伤亡、财产损失等）是决定党纪政务处分种类和程度的重要因素。
后果与社会影响：
- 交通肇事行为造成的后果（如人员伤亡程度、财产损失大小）以及社会影响（如是否引发公众关注、是否损害政府形象等）也是考量处分的重要因素。
认错态度与整改措施：
- 公务员在交通肇事后的认错态度、是否积极配合调查、是否采取有效措施整改等也是影响处分决定的因素。
四、建议与注意事项
及时配合调查：
- 公务员在交通肇事后应积极配合相关部门调查，如实陈述事实，提供相关证据。
主动认错整改：
- 应主动承认错误，积极采取措施整改，以减轻处分程度。
咨询专业意见：
- 在处理党纪政务处分过程中，如有疑问或需要法律帮助，可直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业意见。
总结来说，公务员因交通肇事罪被检察院不予起诉后，仍可能面临党纪政务处分。处分种类和程度需根据具体情节、后果、社会影响以及认错态度等因素综合考量。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。