结论：事业单位工作人员因交通肇事罪检察院不予起诉，单位是否需要追究政纪处分，需结合具体情况判断，一般而言，若行为违反单位规章制度或造成不良影响，单位有权追究政纪处分；若情节轻微且未造成不良影响，单位可能不追究。以下为详细分析：

一、检察院不予起诉的含义

检察院不予起诉，通常意味着检察院认为犯罪嫌疑人的行为虽然构成犯罪，但情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，因此决定不起诉。这并不意味着该行为不构成犯罪，也不意味着该行为没有违反社会道德或单位规章制度。

二、单位追究政纪处分的依据

1. 单位规章制度：事业单位通常有内部的规章制度，对员工的违法行为、违反职业道德或工作纪律的行为有明确的处分规定。如果交通肇事行为违反了单位的规章制度，单位有权根据规章制度对员工进行政纪处分。

2. 造成不良影响：即使检察院不予起诉，但如果交通肇事行为在单位内部或社会上造成了不良影响，如损害了单位的声誉、影响了单位的正常工作秩序等，单位也可能基于维护自身形象和秩序的考虑，对员工进行政纪处分。

三、单位不追究政纪处分的情形

1. 情节轻微且未造成不良影响：如果交通肇事行为情节轻微，且没有在单位内部或社会上造成不良影响，单位可能认为没有必要对员工进行政纪处分。

2. 员工表现良好且认错态度诚恳：如果员工在平时工作中表现良好，且对交通肇事行为有深刻的反省和诚恳的认错态度，单位也可能考虑给予员工一定的宽容和机会，不追究政纪处分。

四、建议与注意事项

1. 了解单位规章制度：员工应详细了解并遵守单位的规章制度，避免因违法行为或违反职业道德的行为而受到政纪处分。

2. 积极配合调查与处理：如果发生交通肇事等违法行为，员工应积极配合相关部门的调查与处理，如实陈述事实，接受相应的法律后果。

3. 寻求法律帮助：如果员工对单位的政纪处分决定有异议，可以寻求法律帮助，通过合法途径维护自己的权益。

举例说明：假设某事业单位员工因交通肇事罪被检察院不予起诉，但该行为在单位内部引起了广泛关注，且对单位的声誉造成了一定影响。在此情况下，单位很可能根据规章制度对员工进行政纪处分，如警告、记过等。反之，如果该行为情节轻微，且未在单位内部或社会上造成不良影响，单位可能选择不追究政纪处分。

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