结论：孩子住院诊断证明丢失的情况下，父母请假照顾孩子是否会被扣工资，需根据具体情况判断，包括请假类型、公司规章制度以及是否符合法律规定等。以下从不同角度进行分析：
一、请假类型与工资扣除
事假：
- 如果父母请的是事假，即因个人原因（如照顾住院孩子）需要请假，那么公司有权根据内部规章制度决定是否扣除工资。
- 通常情况下，事假是无薪的，但具体扣除比例或方式需参照公司规定。如果公司规定事假期间扣除全部或部分工资，且该规定不违反法律法规，那么父母可能会面临工资扣除。
病假或医疗期假：
- 如果父母因自身健康原因（如因照顾孩子而生病）需要请假，且符合公司病假或医疗期假的条件，那么根据法律规定，公司应支付病假工资或医疗期工资，通常不低于当地最低工资标准的80%。
- 但在此情况下，由于是父母自身生病，与孩子住院的直接关联性不强，除非能证明照顾孩子是导致生病的直接原因，否则可能难以直接适用病假或医疗期假的规定。不过，若公司有特别规定或人性化考虑，也可能给予一定照顾。
带薪年休假或其他福利假：
- 如果父母有剩余的带薪年休假或其他福利假，可以选择使用这些假期来照顾孩子。在这种情况下，公司应支付全额工资，不会扣除。
二、公司规章制度与法律法规
- 公司规章制度：公司有权制定内部规章制度来规范员工的请假和工资扣除等事项。但这些规定必须符合国家法律法规的要求，不能侵犯员工的合法权益。
- 法律法规：根据《劳动法》和相关规定，员工在因特殊情况（如家庭成员生病需要照顾）需要请假时，公司应给予一定的理解和支持。虽然法律没有明确规定在这种情况下必须支付全额工资，但公司应合理考虑员工的实际情况，避免过度扣除工资。
三、建议与措施
与公司沟通：
- 父母应首先与公司人力资源部门或上级领导进行沟通，说明孩子住院的实际情况和需要请假照顾的需求。
- 询问公司关于请假和工资扣除的具体规定，并尝试协商一个合理的解决方案。
提供证明材料：
- 尽管诊断证明丢失，但父母可以尝试从医院获取其他相关证明材料，如住院记录、医生建议等，以证明孩子确实住院需要照顾。
- 这些材料可以作为与公司沟通时的依据，增加说服力。
了解法律法规：
- 父母可以了解《劳动法》和相关规定中关于请假和工资扣除的内容，以便在沟通时更好地维护自己的合法权益。
寻求法律援助：
- 如果与公司沟通无果，且认为公司的做法违反了法律法规或侵犯了自己的合法权益，父母可以寻求法律援助或咨询专业律师（如我）来维护自己的权益。
最后，孩子住院诊断证明丢失的情况下，父母请假照顾孩子是否会被扣工资需根据具体情况判断。建议父母首先与公司沟通并了解相关规定，同时尝试提供其他证明材料以支持自己的请假需求。如有需要，可以随时向我咨询相关法律问题。