结论：调休单天是否没有工资，仅全勤奖不被扣除，这并非绝对，而是取决于公司的具体规章制度以及劳动合同中的相关约定。以下从不同角度进行分析：

1. 公司规章制度：

   • 许多公司会在其规章制度中明确规定调休、加班、请假等情形下的工资支付方式。如果公司的规章制度中明确规定调休单天不支付工资，但全勤奖不受影响，那么在这种情况下，员工调休单天确实可能没有工资，而全勤奖则不会被扣除。
   • 然而，如果公司的规章制度中没有这样的明确规定，或者规定与上述情况相反，那么员工调休单天应有权获得相应的工资，且全勤奖的扣除与否也应根据具体规定来判断。

2. 劳动合同约定：

   • 劳动合同是员工与公司之间约定权利义务的重要法律文件。如果劳动合同中明确规定了调休单天的工资支付情况，以及全勤奖的扣除条件，那么双方应严格按照劳动合同的约定执行。
   • 如果劳动合同中没有相关约定，或者约定不明确，那么应参考公司的规章制度以及相关法律法规的规定。

3. 相关法律法规：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工有权获得与其劳动相应的报酬。调休单天，如果员工实际上没有提供劳动（即调休），但这是基于公司的工作安排或员工的合理请求，且公司未因此减少员工的总工作时长或总工资报酬，那么不支付当天工资可能并不违法。然而，这并不意味着公司可以随意扣除员工的全勤奖或其他福利。
   • 全勤奖的扣除通常与员工的出勤情况紧密相关。如果员工因调休而缺勤，但调休是公司允许或安排的，且公司规章制度或劳动合同中未明确规定调休会扣除全勤奖，那么公司不应因此扣除员工的全勤奖。

建议：

• 如果你对公司的调休政策或全勤奖扣除规定有疑问，建议首先查阅公司的规章制度和劳动合同中的相关条款。
• 如果规章制度或劳动合同中没有明确规定，或者你对规定有异议，可以与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解公司的具体做法和依据。
• 如果沟通无果，或者你认为公司的做法违反了相关法律法规或劳动合同的约定，你可以考虑向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

可能后果：

• 如果公司未经你同意或未按照规章制度、劳动合同的约定扣除你的工资或全勤奖，你可能有权要求公司补发相应的款项，并可能因此引发劳动争议。
• 在处理此类争议时，建议你保留好相关的证据，如调休单、工资条、劳动合同、公司规章制度等，以便在需要时证明自己的权益。