针对您提出的问题，即老板涉犯罪，员工所在店铺搜出东西被认定为持有人该怎么办，以下是我的详细分析：

1. 员工是否构成犯罪的关键在于主观明知与客观行为：

   • 主观明知：员工是否知道或应当知道所搜出的物品是犯罪所得或与犯罪有关。如果员工完全不知情，且没有合理的理由应当知情，那么根据罪责自负原则，员工不应因老板的犯罪行为而承担刑事责任。
   • 客观行为：员工是否实施了与犯罪有关的行为，如协助藏匿、转移、销售等。如果员工仅是店铺的普通员工，且没有参与任何与犯罪有关的行为，那么其不应被认定为犯罪。

2. 员工被认定为持有人的法律后果及应对策略：

   • 法律后果：如果员工被错误地认定为持有人，可能会面临刑事指控，如掩饰、隐瞒犯罪所得罪等。这将严重影响员工的个人声誉和未来生活。
   • 应对策略：
     • 收集证据：员工应积极收集能够证明自己不知情的证据，如工作记录、监控录像、同事证言等。这些证据将有助于证明员工没有参与犯罪行为。
     • 及时沟通：员工应尽快与警方或检察机关沟通，说明自己的情况，并提供相关证据。这有助于避免误解和不必要的法律纠纷。
     • 寻求法律帮助：如果员工面临刑事指控，应尽快寻求专业律师的帮助。律师将能够为员工提供法律咨询、代理申诉或辩护等服务，保护员工的合法权益。

3. 店铺物品被搜出与员工责任的关系：

   • 物品性质：首先需要明确所搜出的物品的性质。如果物品确实是犯罪所得或与犯罪有关，那么需要进一步调查其来源和去向。
   • 员工责任：员工是否应对店铺物品负责，取决于其在店铺中的职责和权限。如果员工仅是普通员工，且没有管理或保管店铺物品的职责，那么其不应因物品被搜出而承担责任。
   • 共同犯罪的可能性：如果员工与老板共同实施了犯罪行为，如共同藏匿、转移犯罪所得等，那么员工可能构成共同犯罪，需要承担相应的刑事责任。但这种情况需要具体的证据支持。

4. 实际案例与法律原则的应用：

   • 在实际案例中，法院通常会根据证据来认定员工是否构成犯罪。如果员工能够提供充分的证据证明自己不知情且没有参与犯罪行为，那么法院通常会判决员工无罪。
   • 同时，法院也会遵循罪责自负原则，即刑事责任由犯罪者本人承担，不株连无辜。因此，如果员工确实没有参与犯罪行为，那么其不应因老板的犯罪行为而受到牵连。

总结与建议：

• 如果您作为员工面临此类情况，首先不要惊慌失措，要保持冷静并积极配合警方的调查。
• 尽快收集能够证明自己不知情的证据，并及时与警方或检察机关沟通说明情况。
• 如果面临刑事指控或法律纠纷，务必寻求专业律师的帮助以保护自己的合法权益。

希望以上分析能够对您有所帮助。如果您有任何进一步的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。