结论：单位不同意您手术后医生开具的三个月病假条，这一行为可能涉及对病假合法性的质疑或是对病假期间工资福利的支付存在争议。下面我将从多个角度为您详细分析这一问题，并提供相应的法律建议。
一、病假的合法性
医疗期规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
- 医生开具的病假条，是基于您的病情和医疗需要作出的专业判断，具有法律效力。单位应当尊重医生的诊断意见，不得随意否定。
病假条的审核：
- 单位如果对病假条的真实性或合理性有疑问，可以要求您提供相关的医疗证明或进行复查，但不得无故拒绝承认病假条的效力。
- 如果单位坚持认为病假条不合法或不合理，应当通过合法途径（如向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁）进行解决，而不是单方面拒绝承认。
二、病假期间的工资福利
工资支付：
- 根据《劳动法》和相关规定，职工在病假期间，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资或者疾病救济费。
- 如果单位拒绝支付病假期间的工资，您有权向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求单位支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
福利待遇：
- 病假期间，您仍然享有单位提供的各项福利待遇，如社会保险、住房公积金等。单位不得因您病假而取消或降低这些福利待遇。
三、法律建议
与单位协商：
- 首先，您可以尝试与单位进行沟通，解释病假条的合法性和必要性，以及病假期间工资福利的支付规定。
- 通过协商，寻求双方都能接受的解决方案，如单位承认病假条并支付相应的工资福利。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求单位承认病假条的合法性并支付拖欠的工资及经济补偿。
- 在申请劳动仲裁时，您需要提供相关的证据材料，如病假条、医疗证明、工资单等，以支持您的仲裁请求。
寻求法律援助：
- 如果您在处理这一问题过程中遇到困难或需要进一步的法律帮助，可以随时向我咨询。作为专业律师，我将为您提供全面的法律支持和建议。
四、可能面临的法律后果
- 如果单位无故拒绝承认病假条的合法性或拒绝支付病假期间的工资福利，可能面临劳动行政部门的处罚或劳动仲裁委员会的裁决，要求单位承担相应的法律责任。
- 同时，单位的这一行为也可能影响其企业形象和员工关系，对单位的长期发展产生不利影响。
总结：单位不同意您手术后医生开具的三个月病假条，可能涉及对病假合法性的质疑或是对病假期间工资福利的支付存在争议。您可以通过与单位协商、申请劳动仲裁或寻求法律援助等途径来维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。